Protein–RNA interactions for Protein: Q969Q1

TRIM63, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM63, humanhuman

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Length 353 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM63Q969Q1 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM63Q969Q1 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM63Q969Q1 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM63Q969Q1 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM63Q969Q1 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM63Q969Q1 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM63Q969Q1 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM63Q969Q1 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM63Q969Q1 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM63Q969Q1 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM63Q969Q1 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM63Q969Q1 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM63Q969Q1 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM63Q969Q1 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM63Q969Q1 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM63Q969Q1 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM63Q969Q1 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM63Q969Q1 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM63Q969Q1 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM63Q969Q1 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM63Q969Q1 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM63Q969Q1 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM63Q969Q1 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM63Q969Q1 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM63Q969Q1 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM63Q969Q1 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM63Q969Q1 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM63Q969Q1 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM63Q969Q1 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM63Q969Q1 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM63Q969Q1 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM63Q969Q1 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM63Q969Q1 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM63Q969Q1 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM63Q969Q1 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM63Q969Q1 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIM63Q969Q1 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIM63Q969Q1 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIM63Q969Q1 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIM63Q969Q1 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIM63Q969Q1 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIM63Q969Q1 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIM63Q969Q1 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIM63Q969Q1 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIM63Q969Q1 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIM63Q969Q1 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIM63Q969Q1 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIM63Q969Q1 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIM63Q969Q1 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIM63Q969Q1 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIM63Q969Q1 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIM63Q969Q1 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIM63Q969Q1 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIM63Q969Q1 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIM63Q969Q1 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIM63Q969Q1 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIM63Q969Q1 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIM63Q969Q1 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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TRIM63Q969Q1 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIM63Q969Q1 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIM63Q969Q1 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIM63Q969Q1 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIM63Q969Q1 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIM63Q969Q1 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIM63Q969Q1 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIM63Q969Q1 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIM63Q969Q1 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIM63Q969Q1 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIM63Q969Q1 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIM63Q969Q1 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIM63Q969Q1 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.26
TRIM63Q969Q1 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
TRIM63Q969Q1 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIM63Q969Q1 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIM63Q969Q1 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIM63Q969Q1 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIM63Q969Q1 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIM63Q969Q1 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIM63Q969Q1 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIM63Q969Q1 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIM63Q969Q1 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIM63Q969Q1 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIM63Q969Q1 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIM63Q969Q1 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIM63Q969Q1 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIM63Q969Q1 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIM63Q969Q1 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIM63Q969Q1 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIM63Q969Q1 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIM63Q969Q1 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIM63Q969Q1 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIM63Q969Q1 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIM63Q969Q1 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIM63Q969Q1 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIM63Q969Q1 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIM63Q969Q1 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIM63Q969Q1 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIM63Q969Q1 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIM63Q969Q1 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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