Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF3C6Q969F1 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF3C6Q969F1 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF3C6Q969F1 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF3C6Q969F1 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF3C6Q969F1 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF3C6Q969F1 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF3C6Q969F1 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF3C6Q969F1 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF3C6Q969F1 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF3C6Q969F1 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF3C6Q969F1 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF3C6Q969F1 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF3C6Q969F1 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF3C6Q969F1 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTF3C6Q969F1 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTF3C6Q969F1 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GTF3C6Q969F1 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTF3C6Q969F1 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTF3C6Q969F1 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTF3C6Q969F1 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTF3C6Q969F1 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTF3C6Q969F1 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTF3C6Q969F1 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTF3C6Q969F1 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTF3C6Q969F1 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTF3C6Q969F1 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTF3C6Q969F1 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTF3C6Q969F1 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTF3C6Q969F1 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GTF3C6Q969F1 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTF3C6Q969F1 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTF3C6Q969F1 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTF3C6Q969F1 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTF3C6Q969F1 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTF3C6Q969F1 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTF3C6Q969F1 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTF3C6Q969F1 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTF3C6Q969F1 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTF3C6Q969F1 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTF3C6Q969F1 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GTF3C6Q969F1 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTF3C6Q969F1 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTF3C6Q969F1 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF3C6Q969F1 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF3C6Q969F1 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF3C6Q969F1 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF3C6Q969F1 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF3C6Q969F1 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF3C6Q969F1 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF3C6Q969F1 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF3C6Q969F1 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF3C6Q969F1 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF3C6Q969F1 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF3C6Q969F1 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF3C6Q969F1 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF3C6Q969F1 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF3C6Q969F1 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF3C6Q969F1 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF3C6Q969F1 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF3C6Q969F1 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF3C6Q969F1 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF3C6Q969F1 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF3C6Q969F1 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF3C6Q969F1 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF3C6Q969F1 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF3C6Q969F1 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF3C6Q969F1 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF3C6Q969F1 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF3C6Q969F1 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF3C6Q969F1 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF3C6Q969F1 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF3C6Q969F1 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF3C6Q969F1 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF3C6Q969F1 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF3C6Q969F1 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF3C6Q969F1 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF3C6Q969F1 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF3C6Q969F1 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF3C6Q969F1 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF3C6Q969F1 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF3C6Q969F1 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF3C6Q969F1 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF3C6Q969F1 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF3C6Q969F1 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF3C6Q969F1 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF3C6Q969F1 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF3C6Q969F1 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF3C6Q969F1 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF3C6Q969F1 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF3C6Q969F1 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF3C6Q969F1 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF3C6Q969F1 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF3C6Q969F1 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF3C6Q969F1 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTF3C6Q969F1 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GTF3C6Q969F1 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTF3C6Q969F1 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTF3C6Q969F1 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTF3C6Q969F1 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms