Protein–RNA interactions for Protein: Q8WX93

PALLD, Palladin, humanhuman

Predictions only

Length 1,383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALLDQ8WX93 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PALLDQ8WX93 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PALLDQ8WX93 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PALLDQ8WX93 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PALLDQ8WX93 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PALLDQ8WX93 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PALLDQ8WX93 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PALLDQ8WX93 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PALLDQ8WX93 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PALLDQ8WX93 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PALLDQ8WX93 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PALLDQ8WX93 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PALLDQ8WX93 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PALLDQ8WX93 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PALLDQ8WX93 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PALLDQ8WX93 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PALLDQ8WX93 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PALLDQ8WX93 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PALLDQ8WX93 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PALLDQ8WX93 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PALLDQ8WX93 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PALLDQ8WX93 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PALLDQ8WX93 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PALLDQ8WX93 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PALLDQ8WX93 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PALLDQ8WX93 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PALLDQ8WX93 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PALLDQ8WX93 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PALLDQ8WX93 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PALLDQ8WX93 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PALLDQ8WX93 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PALLDQ8WX93 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PALLDQ8WX93 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PALLDQ8WX93 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PALLDQ8WX93 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PALLDQ8WX93 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PALLDQ8WX93 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PALLDQ8WX93 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PALLDQ8WX93 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PALLDQ8WX93 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
PALLDQ8WX93 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PALLDQ8WX93 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PALLDQ8WX93 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PALLDQ8WX93 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PALLDQ8WX93 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PALLDQ8WX93 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PALLDQ8WX93 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PALLDQ8WX93 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PALLDQ8WX93 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PALLDQ8WX93 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PALLDQ8WX93 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PALLDQ8WX93 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PALLDQ8WX93 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PALLDQ8WX93 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PALLDQ8WX93 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PALLDQ8WX93 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PALLDQ8WX93 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PALLDQ8WX93 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PALLDQ8WX93 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PALLDQ8WX93 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PALLDQ8WX93 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PALLDQ8WX93 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PALLDQ8WX93 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PALLDQ8WX93 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PALLDQ8WX93 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PALLDQ8WX93 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PALLDQ8WX93 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PALLDQ8WX93 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PALLDQ8WX93 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PALLDQ8WX93 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PALLDQ8WX93 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PALLDQ8WX93 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PALLDQ8WX93 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PALLDQ8WX93 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PALLDQ8WX93 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PALLDQ8WX93 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PALLDQ8WX93 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PALLDQ8WX93 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PALLDQ8WX93 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PALLDQ8WX93 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PALLDQ8WX93 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PALLDQ8WX93 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PALLDQ8WX93 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PALLDQ8WX93 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PALLDQ8WX93 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PALLDQ8WX93 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PALLDQ8WX93 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PALLDQ8WX93 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PALLDQ8WX93 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PALLDQ8WX93 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PALLDQ8WX93 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PALLDQ8WX93 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PALLDQ8WX93 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PALLDQ8WX93 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PALLDQ8WX93 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PALLDQ8WX93 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PALLDQ8WX93 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PALLDQ8WX93 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PALLDQ8WX93 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PALLDQ8WX93 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms