Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWI1

LMO7, LIM domain only protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO7Q8WWI1 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LMO7Q8WWI1 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LMO7Q8WWI1 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LMO7Q8WWI1 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LMO7Q8WWI1 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
LMO7Q8WWI1 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LMO7Q8WWI1 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LMO7Q8WWI1 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LMO7Q8WWI1 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LMO7Q8WWI1 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LMO7Q8WWI1 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LMO7Q8WWI1 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LMO7Q8WWI1 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
LMO7Q8WWI1 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LMO7Q8WWI1 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LMO7Q8WWI1 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LMO7Q8WWI1 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LMO7Q8WWI1 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LMO7Q8WWI1 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LMO7Q8WWI1 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LMO7Q8WWI1 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LMO7Q8WWI1 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LMO7Q8WWI1 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LMO7Q8WWI1 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LMO7Q8WWI1 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LMO7Q8WWI1 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LMO7Q8WWI1 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LMO7Q8WWI1 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LMO7Q8WWI1 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LMO7Q8WWI1 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LMO7Q8WWI1 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LMO7Q8WWI1 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
LMO7Q8WWI1 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LMO7Q8WWI1 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LMO7Q8WWI1 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LMO7Q8WWI1 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LMO7Q8WWI1 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LMO7Q8WWI1 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LMO7Q8WWI1 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LMO7Q8WWI1 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LMO7Q8WWI1 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LMO7Q8WWI1 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LMO7Q8WWI1 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LMO7Q8WWI1 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LMO7Q8WWI1 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LMO7Q8WWI1 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LMO7Q8WWI1 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
LMO7Q8WWI1 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
LMO7Q8WWI1 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LMO7Q8WWI1 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LMO7Q8WWI1 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LMO7Q8WWI1 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LMO7Q8WWI1 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LMO7Q8WWI1 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LMO7Q8WWI1 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LMO7Q8WWI1 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LMO7Q8WWI1 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LMO7Q8WWI1 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LMO7Q8WWI1 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
LMO7Q8WWI1 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LMO7Q8WWI1 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LMO7Q8WWI1 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LMO7Q8WWI1 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
LMO7Q8WWI1 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LMO7Q8WWI1 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
LMO7Q8WWI1 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LMO7Q8WWI1 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LMO7Q8WWI1 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LMO7Q8WWI1 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LMO7Q8WWI1 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LMO7Q8WWI1 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LMO7Q8WWI1 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LMO7Q8WWI1 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LMO7Q8WWI1 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LMO7Q8WWI1 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LMO7Q8WWI1 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LMO7Q8WWI1 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LMO7Q8WWI1 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LMO7Q8WWI1 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LMO7Q8WWI1 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LMO7Q8WWI1 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LMO7Q8WWI1 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LMO7Q8WWI1 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LMO7Q8WWI1 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LMO7Q8WWI1 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
LMO7Q8WWI1 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LMO7Q8WWI1 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LMO7Q8WWI1 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LMO7Q8WWI1 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LMO7Q8WWI1 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LMO7Q8WWI1 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LMO7Q8WWI1 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
LMO7Q8WWI1 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LMO7Q8WWI1 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LMO7Q8WWI1 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LMO7Q8WWI1 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LMO7Q8WWI1 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LMO7Q8WWI1 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
LMO7Q8WWI1 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LMO7Q8WWI1 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms