Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV48

CCDC107, Coiled-coil domain-containing protein 107, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC107Q8WV48 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC107Q8WV48 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC107Q8WV48 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC107Q8WV48 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC107Q8WV48 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC107Q8WV48 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC107Q8WV48 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC107Q8WV48 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC107Q8WV48 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC107Q8WV48 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC107Q8WV48 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC107Q8WV48 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC107Q8WV48 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC107Q8WV48 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC107Q8WV48 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC107Q8WV48 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC107Q8WV48 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC107Q8WV48 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC107Q8WV48 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC107Q8WV48 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC107Q8WV48 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC107Q8WV48 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC107Q8WV48 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC107Q8WV48 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC107Q8WV48 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC107Q8WV48 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC107Q8WV48 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CCDC107Q8WV48 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
CCDC107Q8WV48 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC107Q8WV48 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC107Q8WV48 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC107Q8WV48 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC107Q8WV48 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC107Q8WV48 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC107Q8WV48 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC107Q8WV48 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC107Q8WV48 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC107Q8WV48 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC107Q8WV48 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC107Q8WV48 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC107Q8WV48 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC107Q8WV48 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC107Q8WV48 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC107Q8WV48 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC107Q8WV48 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC107Q8WV48 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC107Q8WV48 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC107Q8WV48 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC107Q8WV48 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC107Q8WV48 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC107Q8WV48 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC107Q8WV48 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC107Q8WV48 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC107Q8WV48 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC107Q8WV48 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC107Q8WV48 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC107Q8WV48 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC107Q8WV48 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC107Q8WV48 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC107Q8WV48 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC107Q8WV48 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC107Q8WV48 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC107Q8WV48 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC107Q8WV48 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC107Q8WV48 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC107Q8WV48 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC107Q8WV48 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC107Q8WV48 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC107Q8WV48 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC107Q8WV48 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC107Q8WV48 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC107Q8WV48 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC107Q8WV48 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC107Q8WV48 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC107Q8WV48 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC107Q8WV48 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC107Q8WV48 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC107Q8WV48 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC107Q8WV48 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC107Q8WV48 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC107Q8WV48 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC107Q8WV48 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC107Q8WV48 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC107Q8WV48 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC107Q8WV48 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC107Q8WV48 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC107Q8WV48 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC107Q8WV48 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC107Q8WV48 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC107Q8WV48 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC107Q8WV48 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC107Q8WV48 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC107Q8WV48 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC107Q8WV48 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC107Q8WV48 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC107Q8WV48 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC107Q8WV48 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC107Q8WV48 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC107Q8WV48 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC107Q8WV48 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms