Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDY2

RB1CC1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RB1CC1Q8TDY2 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
RB1CC1Q8TDY2 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
RB1CC1Q8TDY2 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
RB1CC1Q8TDY2 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
RB1CC1Q8TDY2 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
RB1CC1Q8TDY2 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
RB1CC1Q8TDY2 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
RB1CC1Q8TDY2 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC36.49■■■■□ 3.43
RB1CC1Q8TDY2 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
RB1CC1Q8TDY2 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
RB1CC1Q8TDY2 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
RB1CC1Q8TDY2 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
RB1CC1Q8TDY2 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC36.49■■■■□ 3.43
RB1CC1Q8TDY2 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
RB1CC1Q8TDY2 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
RB1CC1Q8TDY2 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
RB1CC1Q8TDY2 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC36.49■■■■□ 3.43
RB1CC1Q8TDY2 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
RB1CC1Q8TDY2 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
RB1CC1Q8TDY2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
RB1CC1Q8TDY2 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
RB1CC1Q8TDY2 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
RB1CC1Q8TDY2 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.48■■■■□ 3.43
RB1CC1Q8TDY2 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
RB1CC1Q8TDY2 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
RB1CC1Q8TDY2 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
RB1CC1Q8TDY2 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
RB1CC1Q8TDY2 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
RB1CC1Q8TDY2 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC36.48■■■■□ 3.43
RB1CC1Q8TDY2 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC36.48■■■■□ 3.43
RB1CC1Q8TDY2 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
RB1CC1Q8TDY2 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC36.48■■■■□ 3.43
RB1CC1Q8TDY2 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
RB1CC1Q8TDY2 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
RB1CC1Q8TDY2 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
RB1CC1Q8TDY2 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
RB1CC1Q8TDY2 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC36.47■■■■□ 3.43
RB1CC1Q8TDY2 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC36.47■■■■□ 3.43
RB1CC1Q8TDY2 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC36.47■■■■□ 3.43
RB1CC1Q8TDY2 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
RB1CC1Q8TDY2 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
RB1CC1Q8TDY2 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC36.47■■■■□ 3.43
RB1CC1Q8TDY2 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
RB1CC1Q8TDY2 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC36.46■■■■□ 3.43
RB1CC1Q8TDY2 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
RB1CC1Q8TDY2 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
RB1CC1Q8TDY2 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
RB1CC1Q8TDY2 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
RB1CC1Q8TDY2 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
RB1CC1Q8TDY2 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
RB1CC1Q8TDY2 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
RB1CC1Q8TDY2 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC36.46■■■■□ 3.43
RB1CC1Q8TDY2 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.43
RB1CC1Q8TDY2 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC36.45■■■■□ 3.43
RB1CC1Q8TDY2 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.43
RB1CC1Q8TDY2 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
RB1CC1Q8TDY2 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
RB1CC1Q8TDY2 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
RB1CC1Q8TDY2 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
RB1CC1Q8TDY2 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
RB1CC1Q8TDY2 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC36.45■■■■□ 3.43
RB1CC1Q8TDY2 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.42
RB1CC1Q8TDY2 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
RB1CC1Q8TDY2 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC36.44■■■■□ 3.42
RB1CC1Q8TDY2 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC36.44■■■■□ 3.42
RB1CC1Q8TDY2 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
RB1CC1Q8TDY2 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC36.44■■■■□ 3.42
RB1CC1Q8TDY2 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC36.44■■■■□ 3.42
RB1CC1Q8TDY2 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
RB1CC1Q8TDY2 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC36.44■■■■□ 3.42
RB1CC1Q8TDY2 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
RB1CC1Q8TDY2 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC36.44■■■■□ 3.42
RB1CC1Q8TDY2 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
RB1CC1Q8TDY2 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
RB1CC1Q8TDY2 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
RB1CC1Q8TDY2 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
RB1CC1Q8TDY2 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
RB1CC1Q8TDY2 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
RB1CC1Q8TDY2 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
RB1CC1Q8TDY2 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
RB1CC1Q8TDY2 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
RB1CC1Q8TDY2 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
RB1CC1Q8TDY2 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
RB1CC1Q8TDY2 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
RB1CC1Q8TDY2 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
RB1CC1Q8TDY2 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
RB1CC1Q8TDY2 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
RB1CC1Q8TDY2 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
RB1CC1Q8TDY2 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
RB1CC1Q8TDY2 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
RB1CC1Q8TDY2 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC36.43■■■■□ 3.42
RB1CC1Q8TDY2 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC36.43■■■■□ 3.42
RB1CC1Q8TDY2 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC36.43■■■■□ 3.42
RB1CC1Q8TDY2 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC36.43■■■■□ 3.42
RB1CC1Q8TDY2 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
RB1CC1Q8TDY2 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
RB1CC1Q8TDY2 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
RB1CC1Q8TDY2 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
RB1CC1Q8TDY2 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
RB1CC1Q8TDY2 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC36.42■■■■□ 3.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms