Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD1

DDX54, ATP-dependent RNA helicase DDX54, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 881 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX54Q8TDD1 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
DDX54Q8TDD1 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
DDX54Q8TDD1 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
DDX54Q8TDD1 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
DDX54Q8TDD1 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
DDX54Q8TDD1 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
DDX54Q8TDD1 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
DDX54Q8TDD1 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
DDX54Q8TDD1 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
DDX54Q8TDD1 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
DDX54Q8TDD1 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
DDX54Q8TDD1 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
DDX54Q8TDD1 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
DDX54Q8TDD1 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
DDX54Q8TDD1 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
DDX54Q8TDD1 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
DDX54Q8TDD1 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
DDX54Q8TDD1 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
DDX54Q8TDD1 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
DDX54Q8TDD1 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DDX54Q8TDD1 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DDX54Q8TDD1 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DDX54Q8TDD1 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DDX54Q8TDD1 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DDX54Q8TDD1 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DDX54Q8TDD1 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DDX54Q8TDD1 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DDX54Q8TDD1 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
DDX54Q8TDD1 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DDX54Q8TDD1 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DDX54Q8TDD1 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DDX54Q8TDD1 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DDX54Q8TDD1 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DDX54Q8TDD1 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DDX54Q8TDD1 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DDX54Q8TDD1 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DDX54Q8TDD1 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DDX54Q8TDD1 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DDX54Q8TDD1 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DDX54Q8TDD1 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DDX54Q8TDD1 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DDX54Q8TDD1 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DDX54Q8TDD1 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
DDX54Q8TDD1 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DDX54Q8TDD1 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DDX54Q8TDD1 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DDX54Q8TDD1 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DDX54Q8TDD1 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DDX54Q8TDD1 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DDX54Q8TDD1 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DDX54Q8TDD1 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DDX54Q8TDD1 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DDX54Q8TDD1 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DDX54Q8TDD1 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DDX54Q8TDD1 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DDX54Q8TDD1 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DDX54Q8TDD1 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DDX54Q8TDD1 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DDX54Q8TDD1 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
DDX54Q8TDD1 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DDX54Q8TDD1 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DDX54Q8TDD1 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DDX54Q8TDD1 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DDX54Q8TDD1 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DDX54Q8TDD1 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
DDX54Q8TDD1 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
DDX54Q8TDD1 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
DDX54Q8TDD1 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DDX54Q8TDD1 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DDX54Q8TDD1 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DDX54Q8TDD1 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
DDX54Q8TDD1 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DDX54Q8TDD1 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DDX54Q8TDD1 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DDX54Q8TDD1 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DDX54Q8TDD1 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DDX54Q8TDD1 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DDX54Q8TDD1 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DDX54Q8TDD1 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DDX54Q8TDD1 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DDX54Q8TDD1 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DDX54Q8TDD1 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DDX54Q8TDD1 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DDX54Q8TDD1 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DDX54Q8TDD1 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
DDX54Q8TDD1 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
DDX54Q8TDD1 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
DDX54Q8TDD1 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DDX54Q8TDD1 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
DDX54Q8TDD1 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
DDX54Q8TDD1 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DDX54Q8TDD1 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DDX54Q8TDD1 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DDX54Q8TDD1 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DDX54Q8TDD1 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DDX54Q8TDD1 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DDX54Q8TDD1 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DDX54Q8TDD1 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DDX54Q8TDD1 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DDX54Q8TDD1 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms