Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEDD1Q8NHV4 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEDD1Q8NHV4 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEDD1Q8NHV4 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEDD1Q8NHV4 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NEDD1Q8NHV4 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NEDD1Q8NHV4 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEDD1Q8NHV4 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NEDD1Q8NHV4 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEDD1Q8NHV4 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEDD1Q8NHV4 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEDD1Q8NHV4 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEDD1Q8NHV4 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEDD1Q8NHV4 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NEDD1Q8NHV4 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEDD1Q8NHV4 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEDD1Q8NHV4 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEDD1Q8NHV4 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
NEDD1Q8NHV4 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
NEDD1Q8NHV4 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEDD1Q8NHV4 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEDD1Q8NHV4 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEDD1Q8NHV4 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEDD1Q8NHV4 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEDD1Q8NHV4 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEDD1Q8NHV4 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEDD1Q8NHV4 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEDD1Q8NHV4 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NEDD1Q8NHV4 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEDD1Q8NHV4 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEDD1Q8NHV4 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEDD1Q8NHV4 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEDD1Q8NHV4 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEDD1Q8NHV4 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEDD1Q8NHV4 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEDD1Q8NHV4 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEDD1Q8NHV4 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEDD1Q8NHV4 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEDD1Q8NHV4 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEDD1Q8NHV4 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEDD1Q8NHV4 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEDD1Q8NHV4 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEDD1Q8NHV4 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEDD1Q8NHV4 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEDD1Q8NHV4 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NEDD1Q8NHV4 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEDD1Q8NHV4 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEDD1Q8NHV4 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEDD1Q8NHV4 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEDD1Q8NHV4 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEDD1Q8NHV4 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEDD1Q8NHV4 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEDD1Q8NHV4 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEDD1Q8NHV4 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEDD1Q8NHV4 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEDD1Q8NHV4 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEDD1Q8NHV4 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEDD1Q8NHV4 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEDD1Q8NHV4 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEDD1Q8NHV4 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEDD1Q8NHV4 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEDD1Q8NHV4 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEDD1Q8NHV4 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEDD1Q8NHV4 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEDD1Q8NHV4 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEDD1Q8NHV4 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEDD1Q8NHV4 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEDD1Q8NHV4 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NEDD1Q8NHV4 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEDD1Q8NHV4 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEDD1Q8NHV4 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NEDD1Q8NHV4 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEDD1Q8NHV4 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEDD1Q8NHV4 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEDD1Q8NHV4 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NEDD1Q8NHV4 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEDD1Q8NHV4 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NEDD1Q8NHV4 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEDD1Q8NHV4 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEDD1Q8NHV4 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEDD1Q8NHV4 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEDD1Q8NHV4 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEDD1Q8NHV4 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEDD1Q8NHV4 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEDD1Q8NHV4 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NEDD1Q8NHV4 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEDD1Q8NHV4 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEDD1Q8NHV4 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NEDD1Q8NHV4 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NEDD1Q8NHV4 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEDD1Q8NHV4 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NEDD1Q8NHV4 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NEDD1Q8NHV4 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEDD1Q8NHV4 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEDD1Q8NHV4 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEDD1Q8NHV4 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEDD1Q8NHV4 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEDD1Q8NHV4 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEDD1Q8NHV4 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEDD1Q8NHV4 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms