Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNF548Q8NEK5 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNF548Q8NEK5 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNF548Q8NEK5 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNF548Q8NEK5 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNF548Q8NEK5 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNF548Q8NEK5 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNF548Q8NEK5 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNF548Q8NEK5 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNF548Q8NEK5 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNF548Q8NEK5 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNF548Q8NEK5 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNF548Q8NEK5 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNF548Q8NEK5 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNF548Q8NEK5 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNF548Q8NEK5 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNF548Q8NEK5 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNF548Q8NEK5 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNF548Q8NEK5 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNF548Q8NEK5 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNF548Q8NEK5 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNF548Q8NEK5 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNF548Q8NEK5 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNF548Q8NEK5 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNF548Q8NEK5 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNF548Q8NEK5 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNF548Q8NEK5 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNF548Q8NEK5 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNF548Q8NEK5 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNF548Q8NEK5 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNF548Q8NEK5 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNF548Q8NEK5 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF548Q8NEK5 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF548Q8NEK5 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF548Q8NEK5 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF548Q8NEK5 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF548Q8NEK5 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF548Q8NEK5 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF548Q8NEK5 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF548Q8NEK5 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF548Q8NEK5 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF548Q8NEK5 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF548Q8NEK5 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF548Q8NEK5 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF548Q8NEK5 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF548Q8NEK5 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF548Q8NEK5 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF548Q8NEK5 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF548Q8NEK5 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF548Q8NEK5 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF548Q8NEK5 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF548Q8NEK5 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF548Q8NEK5 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF548Q8NEK5 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF548Q8NEK5 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF548Q8NEK5 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF548Q8NEK5 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
ZNF548Q8NEK5 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
ZNF548Q8NEK5 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
ZNF548Q8NEK5 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
ZNF548Q8NEK5 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNF548Q8NEK5 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNF548Q8NEK5 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNF548Q8NEK5 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNF548Q8NEK5 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNF548Q8NEK5 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNF548Q8NEK5 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNF548Q8NEK5 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNF548Q8NEK5 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNF548Q8NEK5 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNF548Q8NEK5 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNF548Q8NEK5 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNF548Q8NEK5 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
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ZNF548Q8NEK5 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNF548Q8NEK5 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNF548Q8NEK5 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNF548Q8NEK5 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNF548Q8NEK5 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNF548Q8NEK5 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNF548Q8NEK5 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNF548Q8NEK5 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNF548Q8NEK5 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNF548Q8NEK5 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNF548Q8NEK5 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNF548Q8NEK5 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF548Q8NEK5 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF548Q8NEK5 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF548Q8NEK5 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF548Q8NEK5 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF548Q8NEK5 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF548Q8NEK5 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF548Q8NEK5 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF548Q8NEK5 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF548Q8NEK5 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF548Q8NEK5 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF548Q8NEK5 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF548Q8NEK5 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF548Q8NEK5 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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