Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU1

CCDC197, Putative uncharacterized protein CCDC197, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC197Q8NCU1 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC197Q8NCU1 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC197Q8NCU1 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC197Q8NCU1 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC197Q8NCU1 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC197Q8NCU1 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC197Q8NCU1 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC197Q8NCU1 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC197Q8NCU1 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC197Q8NCU1 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC197Q8NCU1 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC197Q8NCU1 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC197Q8NCU1 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC197Q8NCU1 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC197Q8NCU1 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC197Q8NCU1 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC197Q8NCU1 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC197Q8NCU1 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC197Q8NCU1 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC197Q8NCU1 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC197Q8NCU1 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC197Q8NCU1 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC197Q8NCU1 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC197Q8NCU1 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC197Q8NCU1 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC197Q8NCU1 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC197Q8NCU1 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC197Q8NCU1 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC197Q8NCU1 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC197Q8NCU1 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC197Q8NCU1 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC197Q8NCU1 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC197Q8NCU1 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC197Q8NCU1 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC197Q8NCU1 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC197Q8NCU1 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC197Q8NCU1 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC197Q8NCU1 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC197Q8NCU1 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC197Q8NCU1 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC197Q8NCU1 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC197Q8NCU1 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC197Q8NCU1 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC197Q8NCU1 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC197Q8NCU1 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC197Q8NCU1 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC197Q8NCU1 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC197Q8NCU1 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC197Q8NCU1 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC197Q8NCU1 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC197Q8NCU1 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC197Q8NCU1 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CCDC197Q8NCU1 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CCDC197Q8NCU1 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CCDC197Q8NCU1 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC197Q8NCU1 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC197Q8NCU1 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC197Q8NCU1 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC197Q8NCU1 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC197Q8NCU1 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC197Q8NCU1 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC197Q8NCU1 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC197Q8NCU1 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC197Q8NCU1 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC197Q8NCU1 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC197Q8NCU1 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC197Q8NCU1 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC197Q8NCU1 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC197Q8NCU1 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC197Q8NCU1 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC197Q8NCU1 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC197Q8NCU1 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC197Q8NCU1 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC197Q8NCU1 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC197Q8NCU1 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC197Q8NCU1 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC197Q8NCU1 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC197Q8NCU1 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC197Q8NCU1 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC197Q8NCU1 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC197Q8NCU1 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC197Q8NCU1 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC197Q8NCU1 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC197Q8NCU1 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC197Q8NCU1 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC197Q8NCU1 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC197Q8NCU1 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC197Q8NCU1 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC197Q8NCU1 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC197Q8NCU1 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC197Q8NCU1 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC197Q8NCU1 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC197Q8NCU1 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC197Q8NCU1 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC197Q8NCU1 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC197Q8NCU1 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC197Q8NCU1 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC197Q8NCU1 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC197Q8NCU1 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC197Q8NCU1 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms