Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBN3

TMEM87A, Transmembrane protein 87A, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM87AQ8NBN3 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM87AQ8NBN3 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM87AQ8NBN3 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM87AQ8NBN3 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM87AQ8NBN3 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM87AQ8NBN3 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM87AQ8NBN3 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM87AQ8NBN3 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM87AQ8NBN3 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM87AQ8NBN3 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM87AQ8NBN3 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM87AQ8NBN3 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM87AQ8NBN3 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM87AQ8NBN3 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM87AQ8NBN3 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM87AQ8NBN3 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM87AQ8NBN3 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM87AQ8NBN3 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM87AQ8NBN3 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM87AQ8NBN3 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM87AQ8NBN3 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM87AQ8NBN3 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM87AQ8NBN3 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM87AQ8NBN3 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM87AQ8NBN3 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM87AQ8NBN3 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM87AQ8NBN3 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM87AQ8NBN3 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM87AQ8NBN3 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM87AQ8NBN3 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM87AQ8NBN3 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM87AQ8NBN3 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TMEM87AQ8NBN3 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TMEM87AQ8NBN3 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TMEM87AQ8NBN3 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM87AQ8NBN3 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM87AQ8NBN3 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM87AQ8NBN3 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM87AQ8NBN3 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM87AQ8NBN3 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM87AQ8NBN3 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM87AQ8NBN3 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM87AQ8NBN3 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM87AQ8NBN3 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM87AQ8NBN3 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM87AQ8NBN3 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM87AQ8NBN3 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM87AQ8NBN3 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM87AQ8NBN3 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM87AQ8NBN3 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM87AQ8NBN3 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM87AQ8NBN3 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM87AQ8NBN3 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM87AQ8NBN3 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM87AQ8NBN3 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM87AQ8NBN3 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM87AQ8NBN3 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM87AQ8NBN3 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM87AQ8NBN3 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM87AQ8NBN3 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM87AQ8NBN3 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM87AQ8NBN3 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM87AQ8NBN3 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM87AQ8NBN3 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM87AQ8NBN3 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM87AQ8NBN3 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM87AQ8NBN3 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM87AQ8NBN3 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TMEM87AQ8NBN3 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM87AQ8NBN3 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM87AQ8NBN3 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TMEM87AQ8NBN3 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM87AQ8NBN3 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM87AQ8NBN3 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM87AQ8NBN3 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM87AQ8NBN3 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM87AQ8NBN3 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM87AQ8NBN3 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM87AQ8NBN3 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM87AQ8NBN3 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM87AQ8NBN3 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM87AQ8NBN3 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM87AQ8NBN3 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM87AQ8NBN3 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM87AQ8NBN3 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM87AQ8NBN3 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM87AQ8NBN3 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM87AQ8NBN3 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM87AQ8NBN3 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM87AQ8NBN3 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM87AQ8NBN3 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM87AQ8NBN3 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM87AQ8NBN3 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM87AQ8NBN3 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM87AQ8NBN3 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM87AQ8NBN3 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM87AQ8NBN3 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM87AQ8NBN3 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM87AQ8NBN3 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM87AQ8NBN3 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms