Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9V6

ANKRD53, Ankyrin repeat domain-containing protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD53Q8N9V6 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ANKRD53Q8N9V6 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ANKRD53Q8N9V6 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ANKRD53Q8N9V6 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ANKRD53Q8N9V6 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ANKRD53Q8N9V6 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ANKRD53Q8N9V6 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ANKRD53Q8N9V6 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ANKRD53Q8N9V6 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ANKRD53Q8N9V6 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ANKRD53Q8N9V6 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ANKRD53Q8N9V6 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ANKRD53Q8N9V6 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ANKRD53Q8N9V6 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ANKRD53Q8N9V6 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ANKRD53Q8N9V6 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ANKRD53Q8N9V6 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ANKRD53Q8N9V6 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ANKRD53Q8N9V6 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ANKRD53Q8N9V6 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ANKRD53Q8N9V6 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ANKRD53Q8N9V6 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ANKRD53Q8N9V6 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ANKRD53Q8N9V6 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ANKRD53Q8N9V6 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ANKRD53Q8N9V6 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ANKRD53Q8N9V6 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ANKRD53Q8N9V6 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ANKRD53Q8N9V6 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ANKRD53Q8N9V6 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ANKRD53Q8N9V6 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ANKRD53Q8N9V6 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ANKRD53Q8N9V6 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ANKRD53Q8N9V6 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ANKRD53Q8N9V6 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ANKRD53Q8N9V6 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
ANKRD53Q8N9V6 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
ANKRD53Q8N9V6 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD53Q8N9V6 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD53Q8N9V6 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD53Q8N9V6 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD53Q8N9V6 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD53Q8N9V6 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD53Q8N9V6 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD53Q8N9V6 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD53Q8N9V6 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD53Q8N9V6 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD53Q8N9V6 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD53Q8N9V6 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD53Q8N9V6 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD53Q8N9V6 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD53Q8N9V6 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD53Q8N9V6 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD53Q8N9V6 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD53Q8N9V6 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD53Q8N9V6 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD53Q8N9V6 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD53Q8N9V6 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD53Q8N9V6 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD53Q8N9V6 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD53Q8N9V6 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD53Q8N9V6 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD53Q8N9V6 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD53Q8N9V6 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD53Q8N9V6 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD53Q8N9V6 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD53Q8N9V6 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD53Q8N9V6 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD53Q8N9V6 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD53Q8N9V6 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD53Q8N9V6 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD53Q8N9V6 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD53Q8N9V6 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD53Q8N9V6 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD53Q8N9V6 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD53Q8N9V6 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD53Q8N9V6 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD53Q8N9V6 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD53Q8N9V6 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD53Q8N9V6 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD53Q8N9V6 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD53Q8N9V6 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD53Q8N9V6 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD53Q8N9V6 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD53Q8N9V6 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD53Q8N9V6 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD53Q8N9V6 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD53Q8N9V6 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD53Q8N9V6 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD53Q8N9V6 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD53Q8N9V6 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD53Q8N9V6 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD53Q8N9V6 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD53Q8N9V6 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD53Q8N9V6 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD53Q8N9V6 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD53Q8N9V6 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ANKRD53Q8N9V6 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ANKRD53Q8N9V6 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ANKRD53Q8N9V6 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms