Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5G0

SMIM20, Small integral membrane protein 20, humanhuman

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Length 67 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM20Q8N5G0 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM20Q8N5G0 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM20Q8N5G0 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM20Q8N5G0 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM20Q8N5G0 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM20Q8N5G0 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM20Q8N5G0 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM20Q8N5G0 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM20Q8N5G0 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM20Q8N5G0 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM20Q8N5G0 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM20Q8N5G0 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM20Q8N5G0 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM20Q8N5G0 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM20Q8N5G0 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM20Q8N5G0 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM20Q8N5G0 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM20Q8N5G0 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM20Q8N5G0 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM20Q8N5G0 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM20Q8N5G0 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM20Q8N5G0 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM20Q8N5G0 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM20Q8N5G0 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM20Q8N5G0 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM20Q8N5G0 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM20Q8N5G0 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM20Q8N5G0 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM20Q8N5G0 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM20Q8N5G0 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM20Q8N5G0 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM20Q8N5G0 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM20Q8N5G0 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM20Q8N5G0 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM20Q8N5G0 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM20Q8N5G0 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM20Q8N5G0 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM20Q8N5G0 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM20Q8N5G0 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM20Q8N5G0 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM20Q8N5G0 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM20Q8N5G0 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM20Q8N5G0 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM20Q8N5G0 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM20Q8N5G0 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM20Q8N5G0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM20Q8N5G0 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM20Q8N5G0 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM20Q8N5G0 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM20Q8N5G0 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM20Q8N5G0 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM20Q8N5G0 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM20Q8N5G0 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM20Q8N5G0 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM20Q8N5G0 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM20Q8N5G0 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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SMIM20Q8N5G0 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM20Q8N5G0 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM20Q8N5G0 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM20Q8N5G0 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM20Q8N5G0 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM20Q8N5G0 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM20Q8N5G0 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM20Q8N5G0 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM20Q8N5G0 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM20Q8N5G0 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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SMIM20Q8N5G0 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM20Q8N5G0 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM20Q8N5G0 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM20Q8N5G0 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM20Q8N5G0 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM20Q8N5G0 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM20Q8N5G0 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM20Q8N5G0 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM20Q8N5G0 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM20Q8N5G0 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM20Q8N5G0 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM20Q8N5G0 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM20Q8N5G0 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM20Q8N5G0 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM20Q8N5G0 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM20Q8N5G0 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM20Q8N5G0 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM20Q8N5G0 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM20Q8N5G0 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM20Q8N5G0 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM20Q8N5G0 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM20Q8N5G0 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM20Q8N5G0 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM20Q8N5G0 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM20Q8N5G0 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM20Q8N5G0 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM20Q8N5G0 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
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