Protein–RNA interactions for Protein: Q8N140

EID3, EP300-interacting inhibitor of differentiation 3, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EID3Q8N140 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EID3Q8N140 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EID3Q8N140 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EID3Q8N140 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EID3Q8N140 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EID3Q8N140 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EID3Q8N140 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EID3Q8N140 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EID3Q8N140 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EID3Q8N140 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EID3Q8N140 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EID3Q8N140 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EID3Q8N140 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EID3Q8N140 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EID3Q8N140 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EID3Q8N140 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EID3Q8N140 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
EID3Q8N140 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EID3Q8N140 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EID3Q8N140 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
EID3Q8N140 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EID3Q8N140 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EID3Q8N140 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EID3Q8N140 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EID3Q8N140 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EID3Q8N140 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EID3Q8N140 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EID3Q8N140 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
EID3Q8N140 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EID3Q8N140 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EID3Q8N140 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EID3Q8N140 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EID3Q8N140 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EID3Q8N140 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EID3Q8N140 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EID3Q8N140 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EID3Q8N140 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EID3Q8N140 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EID3Q8N140 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EID3Q8N140 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EID3Q8N140 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EID3Q8N140 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EID3Q8N140 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EID3Q8N140 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EID3Q8N140 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EID3Q8N140 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EID3Q8N140 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EID3Q8N140 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EID3Q8N140 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
EID3Q8N140 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EID3Q8N140 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EID3Q8N140 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EID3Q8N140 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EID3Q8N140 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EID3Q8N140 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EID3Q8N140 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EID3Q8N140 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EID3Q8N140 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EID3Q8N140 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EID3Q8N140 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EID3Q8N140 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EID3Q8N140 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EID3Q8N140 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EID3Q8N140 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EID3Q8N140 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EID3Q8N140 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EID3Q8N140 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EID3Q8N140 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EID3Q8N140 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EID3Q8N140 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EID3Q8N140 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EID3Q8N140 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EID3Q8N140 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EID3Q8N140 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EID3Q8N140 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EID3Q8N140 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EID3Q8N140 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EID3Q8N140 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EID3Q8N140 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EID3Q8N140 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EID3Q8N140 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EID3Q8N140 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EID3Q8N140 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EID3Q8N140 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EID3Q8N140 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EID3Q8N140 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EID3Q8N140 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EID3Q8N140 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EID3Q8N140 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EID3Q8N140 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EID3Q8N140 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EID3Q8N140 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EID3Q8N140 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EID3Q8N140 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EID3Q8N140 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EID3Q8N140 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EID3Q8N140 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EID3Q8N140 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EID3Q8N140 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EID3Q8N140 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms