Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWF9

CCDC83, Coiled-coil domain-containing protein 83, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC83Q8IWF9 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC83Q8IWF9 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC83Q8IWF9 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC83Q8IWF9 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC83Q8IWF9 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC83Q8IWF9 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC83Q8IWF9 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC83Q8IWF9 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC83Q8IWF9 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC83Q8IWF9 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC83Q8IWF9 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC83Q8IWF9 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC83Q8IWF9 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC83Q8IWF9 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC83Q8IWF9 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC83Q8IWF9 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC83Q8IWF9 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC83Q8IWF9 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC83Q8IWF9 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC83Q8IWF9 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC83Q8IWF9 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC83Q8IWF9 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC83Q8IWF9 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC83Q8IWF9 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC83Q8IWF9 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC83Q8IWF9 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC83Q8IWF9 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC83Q8IWF9 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC83Q8IWF9 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC83Q8IWF9 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC83Q8IWF9 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC83Q8IWF9 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC83Q8IWF9 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC83Q8IWF9 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC83Q8IWF9 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC83Q8IWF9 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC83Q8IWF9 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC83Q8IWF9 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC83Q8IWF9 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC83Q8IWF9 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC83Q8IWF9 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC83Q8IWF9 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC83Q8IWF9 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC83Q8IWF9 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC83Q8IWF9 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC83Q8IWF9 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC83Q8IWF9 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC83Q8IWF9 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC83Q8IWF9 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC83Q8IWF9 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC83Q8IWF9 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC83Q8IWF9 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC83Q8IWF9 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC83Q8IWF9 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC83Q8IWF9 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC83Q8IWF9 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC83Q8IWF9 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC83Q8IWF9 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC83Q8IWF9 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC83Q8IWF9 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC83Q8IWF9 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC83Q8IWF9 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC83Q8IWF9 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC83Q8IWF9 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC83Q8IWF9 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC83Q8IWF9 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC83Q8IWF9 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC83Q8IWF9 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC83Q8IWF9 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC83Q8IWF9 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC83Q8IWF9 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC83Q8IWF9 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC83Q8IWF9 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC83Q8IWF9 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC83Q8IWF9 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC83Q8IWF9 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC83Q8IWF9 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC83Q8IWF9 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC83Q8IWF9 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC83Q8IWF9 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC83Q8IWF9 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC83Q8IWF9 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC83Q8IWF9 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC83Q8IWF9 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC83Q8IWF9 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC83Q8IWF9 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC83Q8IWF9 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC83Q8IWF9 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC83Q8IWF9 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC83Q8IWF9 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC83Q8IWF9 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC83Q8IWF9 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC83Q8IWF9 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC83Q8IWF9 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC83Q8IWF9 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC83Q8IWF9 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC83Q8IWF9 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC83Q8IWF9 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC83Q8IWF9 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC83Q8IWF9 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms