Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUI4

SNX29P2, Putative protein SNX29P2, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29P2Q8IUI4 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNX29P2Q8IUI4 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNX29P2Q8IUI4 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNX29P2Q8IUI4 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNX29P2Q8IUI4 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNX29P2Q8IUI4 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNX29P2Q8IUI4 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNX29P2Q8IUI4 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNX29P2Q8IUI4 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNX29P2Q8IUI4 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNX29P2Q8IUI4 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SNX29P2Q8IUI4 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNX29P2Q8IUI4 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNX29P2Q8IUI4 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNX29P2Q8IUI4 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNX29P2Q8IUI4 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNX29P2Q8IUI4 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNX29P2Q8IUI4 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNX29P2Q8IUI4 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNX29P2Q8IUI4 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNX29P2Q8IUI4 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SNX29P2Q8IUI4 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNX29P2Q8IUI4 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNX29P2Q8IUI4 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SNX29P2Q8IUI4 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SNX29P2Q8IUI4 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNX29P2Q8IUI4 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNX29P2Q8IUI4 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNX29P2Q8IUI4 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNX29P2Q8IUI4 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNX29P2Q8IUI4 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNX29P2Q8IUI4 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SNX29P2Q8IUI4 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SNX29P2Q8IUI4 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SNX29P2Q8IUI4 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SNX29P2Q8IUI4 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SNX29P2Q8IUI4 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SNX29P2Q8IUI4 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SNX29P2Q8IUI4 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SNX29P2Q8IUI4 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SNX29P2Q8IUI4 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SNX29P2Q8IUI4 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SNX29P2Q8IUI4 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SNX29P2Q8IUI4 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SNX29P2Q8IUI4 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SNX29P2Q8IUI4 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SNX29P2Q8IUI4 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SNX29P2Q8IUI4 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SNX29P2Q8IUI4 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SNX29P2Q8IUI4 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SNX29P2Q8IUI4 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SNX29P2Q8IUI4 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SNX29P2Q8IUI4 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SNX29P2Q8IUI4 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SNX29P2Q8IUI4 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SNX29P2Q8IUI4 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SNX29P2Q8IUI4 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SNX29P2Q8IUI4 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SNX29P2Q8IUI4 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SNX29P2Q8IUI4 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SNX29P2Q8IUI4 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SNX29P2Q8IUI4 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SNX29P2Q8IUI4 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SNX29P2Q8IUI4 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SNX29P2Q8IUI4 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SNX29P2Q8IUI4 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SNX29P2Q8IUI4 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SNX29P2Q8IUI4 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SNX29P2Q8IUI4 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SNX29P2Q8IUI4 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SNX29P2Q8IUI4 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SNX29P2Q8IUI4 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SNX29P2Q8IUI4 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SNX29P2Q8IUI4 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SNX29P2Q8IUI4 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SNX29P2Q8IUI4 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SNX29P2Q8IUI4 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SNX29P2Q8IUI4 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SNX29P2Q8IUI4 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SNX29P2Q8IUI4 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SNX29P2Q8IUI4 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SNX29P2Q8IUI4 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SNX29P2Q8IUI4 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SNX29P2Q8IUI4 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SNX29P2Q8IUI4 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SNX29P2Q8IUI4 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SNX29P2Q8IUI4 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SNX29P2Q8IUI4 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SNX29P2Q8IUI4 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SNX29P2Q8IUI4 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SNX29P2Q8IUI4 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SNX29P2Q8IUI4 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SNX29P2Q8IUI4 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SNX29P2Q8IUI4 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SNX29P2Q8IUI4 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SNX29P2Q8IUI4 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SNX29P2Q8IUI4 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SNX29P2Q8IUI4 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SNX29P2Q8IUI4 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SNX29P2Q8IUI4 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms