Protein–RNA interactions for Protein: Q86XW9

NME9, Thioredoxin domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME9Q86XW9 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NME9Q86XW9 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
NME9Q86XW9 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NME9Q86XW9 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NME9Q86XW9 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NME9Q86XW9 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NME9Q86XW9 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NME9Q86XW9 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NME9Q86XW9 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NME9Q86XW9 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NME9Q86XW9 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NME9Q86XW9 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
NME9Q86XW9 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
NME9Q86XW9 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
NME9Q86XW9 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NME9Q86XW9 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NME9Q86XW9 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NME9Q86XW9 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NME9Q86XW9 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NME9Q86XW9 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NME9Q86XW9 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NME9Q86XW9 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NME9Q86XW9 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NME9Q86XW9 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NME9Q86XW9 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NME9Q86XW9 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NME9Q86XW9 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NME9Q86XW9 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NME9Q86XW9 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NME9Q86XW9 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NME9Q86XW9 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NME9Q86XW9 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NME9Q86XW9 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NME9Q86XW9 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NME9Q86XW9 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NME9Q86XW9 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
NME9Q86XW9 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NME9Q86XW9 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NME9Q86XW9 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
NME9Q86XW9 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
NME9Q86XW9 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NME9Q86XW9 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NME9Q86XW9 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NME9Q86XW9 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NME9Q86XW9 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NME9Q86XW9 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NME9Q86XW9 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NME9Q86XW9 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NME9Q86XW9 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NME9Q86XW9 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NME9Q86XW9 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NME9Q86XW9 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NME9Q86XW9 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NME9Q86XW9 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NME9Q86XW9 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NME9Q86XW9 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NME9Q86XW9 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NME9Q86XW9 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NME9Q86XW9 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
NME9Q86XW9 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NME9Q86XW9 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NME9Q86XW9 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NME9Q86XW9 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
NME9Q86XW9 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NME9Q86XW9 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NME9Q86XW9 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NME9Q86XW9 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NME9Q86XW9 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NME9Q86XW9 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NME9Q86XW9 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NME9Q86XW9 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NME9Q86XW9 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NME9Q86XW9 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NME9Q86XW9 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NME9Q86XW9 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NME9Q86XW9 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NME9Q86XW9 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NME9Q86XW9 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NME9Q86XW9 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NME9Q86XW9 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NME9Q86XW9 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NME9Q86XW9 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NME9Q86XW9 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NME9Q86XW9 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
NME9Q86XW9 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NME9Q86XW9 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NME9Q86XW9 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NME9Q86XW9 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NME9Q86XW9 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NME9Q86XW9 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NME9Q86XW9 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NME9Q86XW9 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NME9Q86XW9 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NME9Q86XW9 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NME9Q86XW9 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NME9Q86XW9 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NME9Q86XW9 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NME9Q86XW9 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NME9Q86XW9 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NME9Q86XW9 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms