Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAPPC6BQ86SZ2 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms