Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3C6

ATG9A, Autophagy-related protein 9A, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG9AQ7Z3C6 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATG9AQ7Z3C6 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATG9AQ7Z3C6 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATG9AQ7Z3C6 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATG9AQ7Z3C6 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATG9AQ7Z3C6 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ATG9AQ7Z3C6 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATG9AQ7Z3C6 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ATG9AQ7Z3C6 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATG9AQ7Z3C6 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATG9AQ7Z3C6 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATG9AQ7Z3C6 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATG9AQ7Z3C6 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATG9AQ7Z3C6 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATG9AQ7Z3C6 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATG9AQ7Z3C6 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATG9AQ7Z3C6 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATG9AQ7Z3C6 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ATG9AQ7Z3C6 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATG9AQ7Z3C6 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATG9AQ7Z3C6 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATG9AQ7Z3C6 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATG9AQ7Z3C6 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATG9AQ7Z3C6 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATG9AQ7Z3C6 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATG9AQ7Z3C6 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ATG9AQ7Z3C6 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ATG9AQ7Z3C6 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATG9AQ7Z3C6 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ATG9AQ7Z3C6 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATG9AQ7Z3C6 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATG9AQ7Z3C6 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ATG9AQ7Z3C6 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATG9AQ7Z3C6 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATG9AQ7Z3C6 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATG9AQ7Z3C6 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATG9AQ7Z3C6 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATG9AQ7Z3C6 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATG9AQ7Z3C6 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATG9AQ7Z3C6 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATG9AQ7Z3C6 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATG9AQ7Z3C6 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATG9AQ7Z3C6 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATG9AQ7Z3C6 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATG9AQ7Z3C6 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATG9AQ7Z3C6 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATG9AQ7Z3C6 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATG9AQ7Z3C6 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATG9AQ7Z3C6 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATG9AQ7Z3C6 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ATG9AQ7Z3C6 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATG9AQ7Z3C6 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ATG9AQ7Z3C6 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATG9AQ7Z3C6 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATG9AQ7Z3C6 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATG9AQ7Z3C6 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATG9AQ7Z3C6 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATG9AQ7Z3C6 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATG9AQ7Z3C6 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATG9AQ7Z3C6 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATG9AQ7Z3C6 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATG9AQ7Z3C6 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATG9AQ7Z3C6 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ATG9AQ7Z3C6 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ATG9AQ7Z3C6 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATG9AQ7Z3C6 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATG9AQ7Z3C6 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATG9AQ7Z3C6 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATG9AQ7Z3C6 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATG9AQ7Z3C6 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ATG9AQ7Z3C6 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATG9AQ7Z3C6 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATG9AQ7Z3C6 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATG9AQ7Z3C6 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATG9AQ7Z3C6 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATG9AQ7Z3C6 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATG9AQ7Z3C6 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATG9AQ7Z3C6 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATG9AQ7Z3C6 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATG9AQ7Z3C6 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATG9AQ7Z3C6 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATG9AQ7Z3C6 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATG9AQ7Z3C6 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ATG9AQ7Z3C6 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATG9AQ7Z3C6 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATG9AQ7Z3C6 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATG9AQ7Z3C6 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ATG9AQ7Z3C6 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATG9AQ7Z3C6 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATG9AQ7Z3C6 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATG9AQ7Z3C6 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATG9AQ7Z3C6 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATG9AQ7Z3C6 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATG9AQ7Z3C6 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATG9AQ7Z3C6 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATG9AQ7Z3C6 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATG9AQ7Z3C6 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATG9AQ7Z3C6 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATG9AQ7Z3C6 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATG9AQ7Z3C6 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms