Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTM1

OTOP1, Otopetrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP1Q7RTM1 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
OTOP1Q7RTM1 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
OTOP1Q7RTM1 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
OTOP1Q7RTM1 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
OTOP1Q7RTM1 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
OTOP1Q7RTM1 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
OTOP1Q7RTM1 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
OTOP1Q7RTM1 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
OTOP1Q7RTM1 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
OTOP1Q7RTM1 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
OTOP1Q7RTM1 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
OTOP1Q7RTM1 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
OTOP1Q7RTM1 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
OTOP1Q7RTM1 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
OTOP1Q7RTM1 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
OTOP1Q7RTM1 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
OTOP1Q7RTM1 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
OTOP1Q7RTM1 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
OTOP1Q7RTM1 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
OTOP1Q7RTM1 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
OTOP1Q7RTM1 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
OTOP1Q7RTM1 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
OTOP1Q7RTM1 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
OTOP1Q7RTM1 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
OTOP1Q7RTM1 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
OTOP1Q7RTM1 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
OTOP1Q7RTM1 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
OTOP1Q7RTM1 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
OTOP1Q7RTM1 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
OTOP1Q7RTM1 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
OTOP1Q7RTM1 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
OTOP1Q7RTM1 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
OTOP1Q7RTM1 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
OTOP1Q7RTM1 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
OTOP1Q7RTM1 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
OTOP1Q7RTM1 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
OTOP1Q7RTM1 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
OTOP1Q7RTM1 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
OTOP1Q7RTM1 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
OTOP1Q7RTM1 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
OTOP1Q7RTM1 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
OTOP1Q7RTM1 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
OTOP1Q7RTM1 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
OTOP1Q7RTM1 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
OTOP1Q7RTM1 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
OTOP1Q7RTM1 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
OTOP1Q7RTM1 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
OTOP1Q7RTM1 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
OTOP1Q7RTM1 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
OTOP1Q7RTM1 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
OTOP1Q7RTM1 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
OTOP1Q7RTM1 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
OTOP1Q7RTM1 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
OTOP1Q7RTM1 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
OTOP1Q7RTM1 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
OTOP1Q7RTM1 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
OTOP1Q7RTM1 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
OTOP1Q7RTM1 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
OTOP1Q7RTM1 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
OTOP1Q7RTM1 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
OTOP1Q7RTM1 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
OTOP1Q7RTM1 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
OTOP1Q7RTM1 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
OTOP1Q7RTM1 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
OTOP1Q7RTM1 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
OTOP1Q7RTM1 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
OTOP1Q7RTM1 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
OTOP1Q7RTM1 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
OTOP1Q7RTM1 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
OTOP1Q7RTM1 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
OTOP1Q7RTM1 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
OTOP1Q7RTM1 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
OTOP1Q7RTM1 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
OTOP1Q7RTM1 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
OTOP1Q7RTM1 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
OTOP1Q7RTM1 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
OTOP1Q7RTM1 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
OTOP1Q7RTM1 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
OTOP1Q7RTM1 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
OTOP1Q7RTM1 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
OTOP1Q7RTM1 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
OTOP1Q7RTM1 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
OTOP1Q7RTM1 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
OTOP1Q7RTM1 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
OTOP1Q7RTM1 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
OTOP1Q7RTM1 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
OTOP1Q7RTM1 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
OTOP1Q7RTM1 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
OTOP1Q7RTM1 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
OTOP1Q7RTM1 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
OTOP1Q7RTM1 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
OTOP1Q7RTM1 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
OTOP1Q7RTM1 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
OTOP1Q7RTM1 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
OTOP1Q7RTM1 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
OTOP1Q7RTM1 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
OTOP1Q7RTM1 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
OTOP1Q7RTM1 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
OTOP1Q7RTM1 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
OTOP1Q7RTM1 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms