Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
HECW1Q76N89 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
HECW1Q76N89 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
HECW1Q76N89 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
HECW1Q76N89 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
HECW1Q76N89 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
HECW1Q76N89 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
HECW1Q76N89 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
HECW1Q76N89 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
HECW1Q76N89 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
HECW1Q76N89 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
HECW1Q76N89 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
HECW1Q76N89 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
HECW1Q76N89 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
HECW1Q76N89 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
HECW1Q76N89 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
HECW1Q76N89 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
HECW1Q76N89 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
HECW1Q76N89 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
HECW1Q76N89 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
HECW1Q76N89 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
HECW1Q76N89 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
HECW1Q76N89 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
HECW1Q76N89 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
HECW1Q76N89 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
HECW1Q76N89 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
HECW1Q76N89 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
HECW1Q76N89 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
HECW1Q76N89 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
HECW1Q76N89 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
HECW1Q76N89 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
HECW1Q76N89 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
HECW1Q76N89 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC29.53■■■□□ 2.32
HECW1Q76N89 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
HECW1Q76N89 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
HECW1Q76N89 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
HECW1Q76N89 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
HECW1Q76N89 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
HECW1Q76N89 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
HECW1Q76N89 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
HECW1Q76N89 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
HECW1Q76N89 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
HECW1Q76N89 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
HECW1Q76N89 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
HECW1Q76N89 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
HECW1Q76N89 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
HECW1Q76N89 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
HECW1Q76N89 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
HECW1Q76N89 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
HECW1Q76N89 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
HECW1Q76N89 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
HECW1Q76N89 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
HECW1Q76N89 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
HECW1Q76N89 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
HECW1Q76N89 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
HECW1Q76N89 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
HECW1Q76N89 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
HECW1Q76N89 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
HECW1Q76N89 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
HECW1Q76N89 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
HECW1Q76N89 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC29.52■■■□□ 2.32
HECW1Q76N89 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
HECW1Q76N89 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
HECW1Q76N89 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
HECW1Q76N89 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
HECW1Q76N89 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC29.51■■■□□ 2.32
HECW1Q76N89 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.32
HECW1Q76N89 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.32
HECW1Q76N89 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
HECW1Q76N89 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
HECW1Q76N89 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
HECW1Q76N89 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
HECW1Q76N89 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
HECW1Q76N89 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
HECW1Q76N89 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
HECW1Q76N89 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
HECW1Q76N89 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
HECW1Q76N89 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
HECW1Q76N89 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
HECW1Q76N89 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
HECW1Q76N89 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
HECW1Q76N89 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
HECW1Q76N89 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
HECW1Q76N89 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
HECW1Q76N89 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
HECW1Q76N89 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
HECW1Q76N89 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
HECW1Q76N89 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
HECW1Q76N89 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
HECW1Q76N89 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
HECW1Q76N89 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
HECW1Q76N89 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
HECW1Q76N89 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
HECW1Q76N89 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
HECW1Q76N89 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
HECW1Q76N89 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
HECW1Q76N89 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
HECW1Q76N89 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
HECW1Q76N89 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
HECW1Q76N89 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms