Protein–RNA interactions for Protein: Q76I76

SSH2, Protein phosphatase Slingshot homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSH2Q76I76 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SSH2Q76I76 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SSH2Q76I76 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SSH2Q76I76 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SSH2Q76I76 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SSH2Q76I76 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SSH2Q76I76 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SSH2Q76I76 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SSH2Q76I76 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SSH2Q76I76 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SSH2Q76I76 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SSH2Q76I76 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SSH2Q76I76 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SSH2Q76I76 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SSH2Q76I76 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SSH2Q76I76 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SSH2Q76I76 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SSH2Q76I76 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SSH2Q76I76 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SSH2Q76I76 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SSH2Q76I76 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SSH2Q76I76 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SSH2Q76I76 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SSH2Q76I76 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SSH2Q76I76 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SSH2Q76I76 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SSH2Q76I76 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SSH2Q76I76 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SSH2Q76I76 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SSH2Q76I76 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SSH2Q76I76 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SSH2Q76I76 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SSH2Q76I76 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SSH2Q76I76 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SSH2Q76I76 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SSH2Q76I76 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SSH2Q76I76 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SSH2Q76I76 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SSH2Q76I76 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SSH2Q76I76 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SSH2Q76I76 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SSH2Q76I76 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SSH2Q76I76 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SSH2Q76I76 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SSH2Q76I76 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SSH2Q76I76 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SSH2Q76I76 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SSH2Q76I76 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SSH2Q76I76 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SSH2Q76I76 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SSH2Q76I76 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SSH2Q76I76 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SSH2Q76I76 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SSH2Q76I76 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
SSH2Q76I76 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SSH2Q76I76 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SSH2Q76I76 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SSH2Q76I76 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SSH2Q76I76 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
SSH2Q76I76 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SSH2Q76I76 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SSH2Q76I76 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SSH2Q76I76 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SSH2Q76I76 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SSH2Q76I76 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SSH2Q76I76 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
SSH2Q76I76 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
SSH2Q76I76 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SSH2Q76I76 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SSH2Q76I76 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SSH2Q76I76 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SSH2Q76I76 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SSH2Q76I76 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SSH2Q76I76 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SSH2Q76I76 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SSH2Q76I76 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SSH2Q76I76 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SSH2Q76I76 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SSH2Q76I76 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SSH2Q76I76 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SSH2Q76I76 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SSH2Q76I76 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SSH2Q76I76 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SSH2Q76I76 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SSH2Q76I76 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SSH2Q76I76 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SSH2Q76I76 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SSH2Q76I76 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SSH2Q76I76 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SSH2Q76I76 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SSH2Q76I76 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SSH2Q76I76 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SSH2Q76I76 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SSH2Q76I76 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SSH2Q76I76 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SSH2Q76I76 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SSH2Q76I76 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SSH2Q76I76 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SSH2Q76I76 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SSH2Q76I76 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms