Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ4

USP31, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 31, humanhuman

Predictions only

Length 1,352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP31Q70CQ4 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP31Q70CQ4 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP31Q70CQ4 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
USP31Q70CQ4 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP31Q70CQ4 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP31Q70CQ4 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP31Q70CQ4 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
USP31Q70CQ4 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP31Q70CQ4 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
USP31Q70CQ4 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP31Q70CQ4 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP31Q70CQ4 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP31Q70CQ4 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP31Q70CQ4 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP31Q70CQ4 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP31Q70CQ4 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP31Q70CQ4 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP31Q70CQ4 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP31Q70CQ4 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
USP31Q70CQ4 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP31Q70CQ4 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP31Q70CQ4 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
USP31Q70CQ4 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP31Q70CQ4 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
USP31Q70CQ4 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP31Q70CQ4 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP31Q70CQ4 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP31Q70CQ4 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
USP31Q70CQ4 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP31Q70CQ4 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP31Q70CQ4 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP31Q70CQ4 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP31Q70CQ4 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP31Q70CQ4 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP31Q70CQ4 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP31Q70CQ4 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP31Q70CQ4 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP31Q70CQ4 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP31Q70CQ4 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP31Q70CQ4 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
USP31Q70CQ4 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP31Q70CQ4 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP31Q70CQ4 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP31Q70CQ4 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP31Q70CQ4 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP31Q70CQ4 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP31Q70CQ4 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP31Q70CQ4 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP31Q70CQ4 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP31Q70CQ4 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
USP31Q70CQ4 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
USP31Q70CQ4 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP31Q70CQ4 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP31Q70CQ4 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP31Q70CQ4 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP31Q70CQ4 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
USP31Q70CQ4 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP31Q70CQ4 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP31Q70CQ4 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP31Q70CQ4 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP31Q70CQ4 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP31Q70CQ4 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
USP31Q70CQ4 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP31Q70CQ4 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP31Q70CQ4 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP31Q70CQ4 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP31Q70CQ4 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP31Q70CQ4 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP31Q70CQ4 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP31Q70CQ4 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP31Q70CQ4 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP31Q70CQ4 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP31Q70CQ4 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP31Q70CQ4 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP31Q70CQ4 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP31Q70CQ4 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP31Q70CQ4 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP31Q70CQ4 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP31Q70CQ4 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP31Q70CQ4 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP31Q70CQ4 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP31Q70CQ4 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP31Q70CQ4 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP31Q70CQ4 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP31Q70CQ4 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP31Q70CQ4 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
USP31Q70CQ4 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
USP31Q70CQ4 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP31Q70CQ4 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP31Q70CQ4 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP31Q70CQ4 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
USP31Q70CQ4 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
USP31Q70CQ4 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP31Q70CQ4 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP31Q70CQ4 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP31Q70CQ4 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP31Q70CQ4 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP31Q70CQ4 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP31Q70CQ4 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP31Q70CQ4 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms