Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV73

FGD6, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD6Q6ZV73 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
FGD6Q6ZV73 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
FGD6Q6ZV73 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
FGD6Q6ZV73 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
FGD6Q6ZV73 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
FGD6Q6ZV73 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
FGD6Q6ZV73 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
FGD6Q6ZV73 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
FGD6Q6ZV73 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
FGD6Q6ZV73 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
FGD6Q6ZV73 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
FGD6Q6ZV73 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
FGD6Q6ZV73 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
FGD6Q6ZV73 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
FGD6Q6ZV73 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
FGD6Q6ZV73 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
FGD6Q6ZV73 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
FGD6Q6ZV73 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
FGD6Q6ZV73 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
FGD6Q6ZV73 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
FGD6Q6ZV73 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
FGD6Q6ZV73 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
FGD6Q6ZV73 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
FGD6Q6ZV73 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
FGD6Q6ZV73 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
FGD6Q6ZV73 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
FGD6Q6ZV73 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
FGD6Q6ZV73 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
FGD6Q6ZV73 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
FGD6Q6ZV73 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
FGD6Q6ZV73 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
FGD6Q6ZV73 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
FGD6Q6ZV73 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
FGD6Q6ZV73 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
FGD6Q6ZV73 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
FGD6Q6ZV73 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
FGD6Q6ZV73 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
FGD6Q6ZV73 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
FGD6Q6ZV73 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
FGD6Q6ZV73 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
FGD6Q6ZV73 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
FGD6Q6ZV73 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
FGD6Q6ZV73 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
FGD6Q6ZV73 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
FGD6Q6ZV73 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
FGD6Q6ZV73 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
FGD6Q6ZV73 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
FGD6Q6ZV73 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
FGD6Q6ZV73 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
FGD6Q6ZV73 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
FGD6Q6ZV73 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
FGD6Q6ZV73 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
FGD6Q6ZV73 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
FGD6Q6ZV73 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC28.78■■■□□ 2.2
FGD6Q6ZV73 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
FGD6Q6ZV73 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
FGD6Q6ZV73 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
FGD6Q6ZV73 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
FGD6Q6ZV73 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
FGD6Q6ZV73 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
FGD6Q6ZV73 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
FGD6Q6ZV73 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
FGD6Q6ZV73 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
FGD6Q6ZV73 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
FGD6Q6ZV73 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
FGD6Q6ZV73 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
FGD6Q6ZV73 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
FGD6Q6ZV73 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
FGD6Q6ZV73 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
FGD6Q6ZV73 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
FGD6Q6ZV73 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
FGD6Q6ZV73 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
FGD6Q6ZV73 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
FGD6Q6ZV73 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
FGD6Q6ZV73 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
FGD6Q6ZV73 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
FGD6Q6ZV73 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
FGD6Q6ZV73 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
FGD6Q6ZV73 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
FGD6Q6ZV73 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
FGD6Q6ZV73 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
FGD6Q6ZV73 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
FGD6Q6ZV73 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
FGD6Q6ZV73 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
FGD6Q6ZV73 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
FGD6Q6ZV73 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
FGD6Q6ZV73 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
FGD6Q6ZV73 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
FGD6Q6ZV73 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
FGD6Q6ZV73 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
FGD6Q6ZV73 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
FGD6Q6ZV73 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
FGD6Q6ZV73 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
FGD6Q6ZV73 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
FGD6Q6ZV73 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
FGD6Q6ZV73 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
FGD6Q6ZV73 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
FGD6Q6ZV73 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
FGD6Q6ZV73 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
FGD6Q6ZV73 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms