Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRS4

CCDC129, Coiled-coil domain-containing protein 129, humanhuman

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC129Q6ZRS4 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC129Q6ZRS4 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC129Q6ZRS4 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC129Q6ZRS4 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC129Q6ZRS4 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC129Q6ZRS4 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC129Q6ZRS4 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC129Q6ZRS4 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC129Q6ZRS4 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC129Q6ZRS4 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC129Q6ZRS4 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC129Q6ZRS4 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC129Q6ZRS4 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC129Q6ZRS4 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC129Q6ZRS4 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC129Q6ZRS4 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC129Q6ZRS4 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC129Q6ZRS4 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC129Q6ZRS4 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC129Q6ZRS4 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC129Q6ZRS4 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC129Q6ZRS4 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC129Q6ZRS4 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC129Q6ZRS4 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC129Q6ZRS4 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC129Q6ZRS4 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC129Q6ZRS4 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC129Q6ZRS4 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC129Q6ZRS4 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC129Q6ZRS4 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC129Q6ZRS4 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC129Q6ZRS4 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC129Q6ZRS4 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC129Q6ZRS4 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC129Q6ZRS4 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC129Q6ZRS4 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC129Q6ZRS4 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC129Q6ZRS4 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC129Q6ZRS4 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC129Q6ZRS4 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC129Q6ZRS4 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC129Q6ZRS4 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC129Q6ZRS4 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC129Q6ZRS4 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC129Q6ZRS4 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC129Q6ZRS4 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC129Q6ZRS4 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC129Q6ZRS4 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC129Q6ZRS4 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC129Q6ZRS4 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC129Q6ZRS4 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC129Q6ZRS4 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC129Q6ZRS4 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC129Q6ZRS4 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC129Q6ZRS4 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC129Q6ZRS4 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC129Q6ZRS4 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC129Q6ZRS4 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC129Q6ZRS4 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC129Q6ZRS4 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC129Q6ZRS4 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC129Q6ZRS4 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC129Q6ZRS4 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC129Q6ZRS4 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC129Q6ZRS4 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC129Q6ZRS4 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC129Q6ZRS4 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC129Q6ZRS4 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC129Q6ZRS4 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC129Q6ZRS4 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC129Q6ZRS4 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC129Q6ZRS4 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC129Q6ZRS4 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC129Q6ZRS4 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC129Q6ZRS4 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC129Q6ZRS4 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC129Q6ZRS4 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC129Q6ZRS4 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC129Q6ZRS4 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC129Q6ZRS4 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC129Q6ZRS4 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC129Q6ZRS4 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC129Q6ZRS4 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC129Q6ZRS4 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC129Q6ZRS4 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC129Q6ZRS4 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC129Q6ZRS4 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC129Q6ZRS4 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC129Q6ZRS4 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC129Q6ZRS4 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC129Q6ZRS4 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC129Q6ZRS4 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC129Q6ZRS4 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC129Q6ZRS4 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC129Q6ZRS4 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC129Q6ZRS4 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC129Q6ZRS4 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC129Q6ZRS4 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC129Q6ZRS4 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC129Q6ZRS4 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms