Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZP82

CCDC141, Coiled-coil domain-containing protein 141, humanhuman

Predictions only

Length 1,450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC141Q6ZP82 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC141Q6ZP82 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC141Q6ZP82 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC141Q6ZP82 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC141Q6ZP82 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC141Q6ZP82 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC141Q6ZP82 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC141Q6ZP82 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC141Q6ZP82 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC141Q6ZP82 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC141Q6ZP82 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC141Q6ZP82 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC141Q6ZP82 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC141Q6ZP82 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC141Q6ZP82 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC141Q6ZP82 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC141Q6ZP82 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC141Q6ZP82 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC141Q6ZP82 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC141Q6ZP82 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC141Q6ZP82 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC141Q6ZP82 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC141Q6ZP82 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC141Q6ZP82 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC141Q6ZP82 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC141Q6ZP82 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC141Q6ZP82 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC141Q6ZP82 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC141Q6ZP82 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC141Q6ZP82 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC141Q6ZP82 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC141Q6ZP82 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC141Q6ZP82 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC141Q6ZP82 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC141Q6ZP82 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC141Q6ZP82 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC141Q6ZP82 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC141Q6ZP82 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC141Q6ZP82 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC141Q6ZP82 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC141Q6ZP82 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC141Q6ZP82 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC141Q6ZP82 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC141Q6ZP82 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC141Q6ZP82 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC141Q6ZP82 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC141Q6ZP82 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC141Q6ZP82 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC141Q6ZP82 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC141Q6ZP82 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC141Q6ZP82 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC141Q6ZP82 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC141Q6ZP82 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC141Q6ZP82 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC141Q6ZP82 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC141Q6ZP82 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC141Q6ZP82 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC141Q6ZP82 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC141Q6ZP82 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC141Q6ZP82 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC141Q6ZP82 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC141Q6ZP82 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC141Q6ZP82 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC141Q6ZP82 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC141Q6ZP82 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC141Q6ZP82 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC141Q6ZP82 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC141Q6ZP82 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC141Q6ZP82 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC141Q6ZP82 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC141Q6ZP82 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCDC141Q6ZP82 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCDC141Q6ZP82 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCDC141Q6ZP82 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCDC141Q6ZP82 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
CCDC141Q6ZP82 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
CCDC141Q6ZP82 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.13
CCDC141Q6ZP82 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.13
CCDC141Q6ZP82 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
CCDC141Q6ZP82 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC28.39■■■□□ 2.13
CCDC141Q6ZP82 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
CCDC141Q6ZP82 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
CCDC141Q6ZP82 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC141Q6ZP82 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC141Q6ZP82 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC141Q6ZP82 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC141Q6ZP82 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC141Q6ZP82 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC141Q6ZP82 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC141Q6ZP82 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC141Q6ZP82 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC141Q6ZP82 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC141Q6ZP82 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC141Q6ZP82 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC141Q6ZP82 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC141Q6ZP82 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC141Q6ZP82 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC141Q6ZP82 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC141Q6ZP82 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC141Q6ZP82 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms