Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUI1

CCDC144NL, Putative coiled-coil domain-containing protein 144 N-terminal-like, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC144NLQ6NUI1 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC144NLQ6NUI1 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC144NLQ6NUI1 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC144NLQ6NUI1 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC144NLQ6NUI1 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC144NLQ6NUI1 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC144NLQ6NUI1 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCDC144NLQ6NUI1 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCDC144NLQ6NUI1 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCDC144NLQ6NUI1 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCDC144NLQ6NUI1 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCDC144NLQ6NUI1 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC144NLQ6NUI1 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC144NLQ6NUI1 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC144NLQ6NUI1 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC144NLQ6NUI1 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC144NLQ6NUI1 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC144NLQ6NUI1 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC144NLQ6NUI1 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC144NLQ6NUI1 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC144NLQ6NUI1 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC144NLQ6NUI1 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC144NLQ6NUI1 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC144NLQ6NUI1 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC144NLQ6NUI1 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC144NLQ6NUI1 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC144NLQ6NUI1 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC144NLQ6NUI1 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC144NLQ6NUI1 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC144NLQ6NUI1 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC144NLQ6NUI1 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC144NLQ6NUI1 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC144NLQ6NUI1 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC144NLQ6NUI1 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC144NLQ6NUI1 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC144NLQ6NUI1 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC144NLQ6NUI1 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC144NLQ6NUI1 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC144NLQ6NUI1 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC144NLQ6NUI1 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC144NLQ6NUI1 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC144NLQ6NUI1 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC144NLQ6NUI1 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC144NLQ6NUI1 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC144NLQ6NUI1 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC144NLQ6NUI1 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC144NLQ6NUI1 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC144NLQ6NUI1 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC144NLQ6NUI1 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC144NLQ6NUI1 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC144NLQ6NUI1 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC144NLQ6NUI1 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC144NLQ6NUI1 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC144NLQ6NUI1 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC144NLQ6NUI1 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC144NLQ6NUI1 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC144NLQ6NUI1 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC144NLQ6NUI1 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC144NLQ6NUI1 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC144NLQ6NUI1 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC144NLQ6NUI1 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC144NLQ6NUI1 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC144NLQ6NUI1 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC144NLQ6NUI1 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC144NLQ6NUI1 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC144NLQ6NUI1 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC144NLQ6NUI1 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC144NLQ6NUI1 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC144NLQ6NUI1 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC144NLQ6NUI1 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC144NLQ6NUI1 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC144NLQ6NUI1 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC144NLQ6NUI1 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC144NLQ6NUI1 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC144NLQ6NUI1 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC144NLQ6NUI1 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC144NLQ6NUI1 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC144NLQ6NUI1 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC144NLQ6NUI1 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC144NLQ6NUI1 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC144NLQ6NUI1 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC144NLQ6NUI1 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC144NLQ6NUI1 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC144NLQ6NUI1 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC144NLQ6NUI1 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC144NLQ6NUI1 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC144NLQ6NUI1 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC144NLQ6NUI1 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC144NLQ6NUI1 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC144NLQ6NUI1 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC144NLQ6NUI1 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC144NLQ6NUI1 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC144NLQ6NUI1 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC144NLQ6NUI1 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC144NLQ6NUI1 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC144NLQ6NUI1 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC144NLQ6NUI1 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC144NLQ6NUI1 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC144NLQ6NUI1 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC144NLQ6NUI1 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.2 ms