Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT76

HMBOX1, Homeobox-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMBOX1Q6NT76 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HMBOX1Q6NT76 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HMBOX1Q6NT76 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HMBOX1Q6NT76 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HMBOX1Q6NT76 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HMBOX1Q6NT76 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HMBOX1Q6NT76 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HMBOX1Q6NT76 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HMBOX1Q6NT76 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HMBOX1Q6NT76 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HMBOX1Q6NT76 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HMBOX1Q6NT76 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HMBOX1Q6NT76 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HMBOX1Q6NT76 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HMBOX1Q6NT76 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HMBOX1Q6NT76 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HMBOX1Q6NT76 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HMBOX1Q6NT76 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HMBOX1Q6NT76 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HMBOX1Q6NT76 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HMBOX1Q6NT76 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HMBOX1Q6NT76 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HMBOX1Q6NT76 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HMBOX1Q6NT76 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HMBOX1Q6NT76 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HMBOX1Q6NT76 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HMBOX1Q6NT76 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HMBOX1Q6NT76 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HMBOX1Q6NT76 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HMBOX1Q6NT76 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HMBOX1Q6NT76 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HMBOX1Q6NT76 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HMBOX1Q6NT76 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HMBOX1Q6NT76 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HMBOX1Q6NT76 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HMBOX1Q6NT76 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HMBOX1Q6NT76 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HMBOX1Q6NT76 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HMBOX1Q6NT76 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HMBOX1Q6NT76 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HMBOX1Q6NT76 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HMBOX1Q6NT76 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HMBOX1Q6NT76 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HMBOX1Q6NT76 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HMBOX1Q6NT76 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HMBOX1Q6NT76 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HMBOX1Q6NT76 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HMBOX1Q6NT76 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HMBOX1Q6NT76 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HMBOX1Q6NT76 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HMBOX1Q6NT76 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HMBOX1Q6NT76 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HMBOX1Q6NT76 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HMBOX1Q6NT76 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HMBOX1Q6NT76 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HMBOX1Q6NT76 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HMBOX1Q6NT76 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HMBOX1Q6NT76 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HMBOX1Q6NT76 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HMBOX1Q6NT76 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HMBOX1Q6NT76 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HMBOX1Q6NT76 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HMBOX1Q6NT76 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HMBOX1Q6NT76 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HMBOX1Q6NT76 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HMBOX1Q6NT76 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HMBOX1Q6NT76 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HMBOX1Q6NT76 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HMBOX1Q6NT76 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HMBOX1Q6NT76 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
HMBOX1Q6NT76 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HMBOX1Q6NT76 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HMBOX1Q6NT76 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HMBOX1Q6NT76 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HMBOX1Q6NT76 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HMBOX1Q6NT76 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HMBOX1Q6NT76 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HMBOX1Q6NT76 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HMBOX1Q6NT76 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
HMBOX1Q6NT76 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HMBOX1Q6NT76 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HMBOX1Q6NT76 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HMBOX1Q6NT76 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HMBOX1Q6NT76 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HMBOX1Q6NT76 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HMBOX1Q6NT76 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HMBOX1Q6NT76 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HMBOX1Q6NT76 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HMBOX1Q6NT76 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HMBOX1Q6NT76 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HMBOX1Q6NT76 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HMBOX1Q6NT76 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HMBOX1Q6NT76 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HMBOX1Q6NT76 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HMBOX1Q6NT76 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HMBOX1Q6NT76 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HMBOX1Q6NT76 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HMBOX1Q6NT76 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HMBOX1Q6NT76 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HMBOX1Q6NT76 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms