Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CARMIL2Q6F5E8 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CARMIL2Q6F5E8 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CARMIL2Q6F5E8 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
CARMIL2Q6F5E8 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CARMIL2Q6F5E8 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CARMIL2Q6F5E8 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
CARMIL2Q6F5E8 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CARMIL2Q6F5E8 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CARMIL2Q6F5E8 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CARMIL2Q6F5E8 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CARMIL2Q6F5E8 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CARMIL2Q6F5E8 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CARMIL2Q6F5E8 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CARMIL2Q6F5E8 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
CARMIL2Q6F5E8 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
CARMIL2Q6F5E8 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
CARMIL2Q6F5E8 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CARMIL2Q6F5E8 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CARMIL2Q6F5E8 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CARMIL2Q6F5E8 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CARMIL2Q6F5E8 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
CARMIL2Q6F5E8 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
CARMIL2Q6F5E8 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CARMIL2Q6F5E8 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CARMIL2Q6F5E8 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CARMIL2Q6F5E8 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CARMIL2Q6F5E8 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CARMIL2Q6F5E8 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CARMIL2Q6F5E8 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CARMIL2Q6F5E8 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CARMIL2Q6F5E8 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CARMIL2Q6F5E8 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CARMIL2Q6F5E8 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CARMIL2Q6F5E8 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CARMIL2Q6F5E8 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CARMIL2Q6F5E8 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CARMIL2Q6F5E8 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CARMIL2Q6F5E8 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CARMIL2Q6F5E8 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CARMIL2Q6F5E8 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CARMIL2Q6F5E8 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CARMIL2Q6F5E8 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CARMIL2Q6F5E8 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
CARMIL2Q6F5E8 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CARMIL2Q6F5E8 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CARMIL2Q6F5E8 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CARMIL2Q6F5E8 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CARMIL2Q6F5E8 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CARMIL2Q6F5E8 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CARMIL2Q6F5E8 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CARMIL2Q6F5E8 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CARMIL2Q6F5E8 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CARMIL2Q6F5E8 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CARMIL2Q6F5E8 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CARMIL2Q6F5E8 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CARMIL2Q6F5E8 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CARMIL2Q6F5E8 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
CARMIL2Q6F5E8 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CARMIL2Q6F5E8 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CARMIL2Q6F5E8 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CARMIL2Q6F5E8 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CARMIL2Q6F5E8 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CARMIL2Q6F5E8 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CARMIL2Q6F5E8 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CARMIL2Q6F5E8 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CARMIL2Q6F5E8 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CARMIL2Q6F5E8 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
CARMIL2Q6F5E8 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CARMIL2Q6F5E8 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CARMIL2Q6F5E8 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
CARMIL2Q6F5E8 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CARMIL2Q6F5E8 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CARMIL2Q6F5E8 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CARMIL2Q6F5E8 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CARMIL2Q6F5E8 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CARMIL2Q6F5E8 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CARMIL2Q6F5E8 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CARMIL2Q6F5E8 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CARMIL2Q6F5E8 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CARMIL2Q6F5E8 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CARMIL2Q6F5E8 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CARMIL2Q6F5E8 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CARMIL2Q6F5E8 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CARMIL2Q6F5E8 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
CARMIL2Q6F5E8 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CARMIL2Q6F5E8 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
CARMIL2Q6F5E8 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CARMIL2Q6F5E8 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CARMIL2Q6F5E8 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CARMIL2Q6F5E8 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CARMIL2Q6F5E8 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CARMIL2Q6F5E8 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CARMIL2Q6F5E8 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CARMIL2Q6F5E8 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CARMIL2Q6F5E8 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CARMIL2Q6F5E8 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
CARMIL2Q6F5E8 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CARMIL2Q6F5E8 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CARMIL2Q6F5E8 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms