Protein–RNA interactions for Protein: Q68CJ9

CREB3L3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3L3Q68CJ9 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CREB3L3Q68CJ9 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CREB3L3Q68CJ9 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CREB3L3Q68CJ9 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CREB3L3Q68CJ9 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CREB3L3Q68CJ9 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CREB3L3Q68CJ9 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CREB3L3Q68CJ9 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CREB3L3Q68CJ9 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CREB3L3Q68CJ9 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CREB3L3Q68CJ9 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CREB3L3Q68CJ9 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CREB3L3Q68CJ9 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CREB3L3Q68CJ9 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CREB3L3Q68CJ9 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CREB3L3Q68CJ9 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CREB3L3Q68CJ9 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CREB3L3Q68CJ9 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CREB3L3Q68CJ9 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CREB3L3Q68CJ9 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CREB3L3Q68CJ9 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CREB3L3Q68CJ9 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CREB3L3Q68CJ9 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CREB3L3Q68CJ9 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CREB3L3Q68CJ9 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CREB3L3Q68CJ9 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CREB3L3Q68CJ9 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CREB3L3Q68CJ9 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CREB3L3Q68CJ9 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CREB3L3Q68CJ9 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CREB3L3Q68CJ9 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CREB3L3Q68CJ9 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CREB3L3Q68CJ9 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CREB3L3Q68CJ9 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CREB3L3Q68CJ9 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CREB3L3Q68CJ9 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CREB3L3Q68CJ9 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CREB3L3Q68CJ9 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CREB3L3Q68CJ9 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CREB3L3Q68CJ9 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CREB3L3Q68CJ9 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CREB3L3Q68CJ9 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CREB3L3Q68CJ9 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CREB3L3Q68CJ9 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CREB3L3Q68CJ9 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CREB3L3Q68CJ9 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CREB3L3Q68CJ9 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CREB3L3Q68CJ9 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CREB3L3Q68CJ9 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CREB3L3Q68CJ9 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CREB3L3Q68CJ9 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CREB3L3Q68CJ9 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CREB3L3Q68CJ9 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CREB3L3Q68CJ9 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CREB3L3Q68CJ9 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CREB3L3Q68CJ9 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CREB3L3Q68CJ9 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CREB3L3Q68CJ9 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CREB3L3Q68CJ9 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CREB3L3Q68CJ9 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CREB3L3Q68CJ9 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CREB3L3Q68CJ9 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CREB3L3Q68CJ9 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CREB3L3Q68CJ9 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CREB3L3Q68CJ9 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CREB3L3Q68CJ9 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CREB3L3Q68CJ9 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CREB3L3Q68CJ9 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CREB3L3Q68CJ9 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CREB3L3Q68CJ9 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CREB3L3Q68CJ9 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CREB3L3Q68CJ9 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CREB3L3Q68CJ9 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CREB3L3Q68CJ9 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CREB3L3Q68CJ9 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CREB3L3Q68CJ9 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CREB3L3Q68CJ9 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CREB3L3Q68CJ9 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CREB3L3Q68CJ9 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CREB3L3Q68CJ9 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CREB3L3Q68CJ9 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CREB3L3Q68CJ9 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CREB3L3Q68CJ9 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CREB3L3Q68CJ9 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CREB3L3Q68CJ9 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CREB3L3Q68CJ9 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CREB3L3Q68CJ9 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CREB3L3Q68CJ9 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CREB3L3Q68CJ9 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CREB3L3Q68CJ9 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CREB3L3Q68CJ9 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CREB3L3Q68CJ9 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CREB3L3Q68CJ9 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CREB3L3Q68CJ9 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CREB3L3Q68CJ9 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CREB3L3Q68CJ9 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CREB3L3Q68CJ9 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CREB3L3Q68CJ9 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CREB3L3Q68CJ9 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CREB3L3Q68CJ9 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms