Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVW2

GARNL3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3Q5VVW2 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GARNL3Q5VVW2 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GARNL3Q5VVW2 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GARNL3Q5VVW2 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GARNL3Q5VVW2 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GARNL3Q5VVW2 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GARNL3Q5VVW2 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GARNL3Q5VVW2 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GARNL3Q5VVW2 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GARNL3Q5VVW2 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GARNL3Q5VVW2 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GARNL3Q5VVW2 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GARNL3Q5VVW2 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GARNL3Q5VVW2 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GARNL3Q5VVW2 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GARNL3Q5VVW2 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GARNL3Q5VVW2 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GARNL3Q5VVW2 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GARNL3Q5VVW2 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GARNL3Q5VVW2 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GARNL3Q5VVW2 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GARNL3Q5VVW2 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
GARNL3Q5VVW2 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GARNL3Q5VVW2 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GARNL3Q5VVW2 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GARNL3Q5VVW2 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GARNL3Q5VVW2 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GARNL3Q5VVW2 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GARNL3Q5VVW2 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GARNL3Q5VVW2 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GARNL3Q5VVW2 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GARNL3Q5VVW2 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GARNL3Q5VVW2 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GARNL3Q5VVW2 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GARNL3Q5VVW2 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GARNL3Q5VVW2 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GARNL3Q5VVW2 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GARNL3Q5VVW2 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GARNL3Q5VVW2 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GARNL3Q5VVW2 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GARNL3Q5VVW2 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GARNL3Q5VVW2 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GARNL3Q5VVW2 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GARNL3Q5VVW2 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GARNL3Q5VVW2 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GARNL3Q5VVW2 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GARNL3Q5VVW2 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GARNL3Q5VVW2 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GARNL3Q5VVW2 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GARNL3Q5VVW2 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GARNL3Q5VVW2 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GARNL3Q5VVW2 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GARNL3Q5VVW2 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GARNL3Q5VVW2 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GARNL3Q5VVW2 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GARNL3Q5VVW2 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GARNL3Q5VVW2 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
GARNL3Q5VVW2 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GARNL3Q5VVW2 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GARNL3Q5VVW2 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GARNL3Q5VVW2 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GARNL3Q5VVW2 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GARNL3Q5VVW2 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GARNL3Q5VVW2 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
GARNL3Q5VVW2 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
GARNL3Q5VVW2 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GARNL3Q5VVW2 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GARNL3Q5VVW2 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GARNL3Q5VVW2 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GARNL3Q5VVW2 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GARNL3Q5VVW2 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GARNL3Q5VVW2 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GARNL3Q5VVW2 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GARNL3Q5VVW2 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GARNL3Q5VVW2 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GARNL3Q5VVW2 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GARNL3Q5VVW2 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GARNL3Q5VVW2 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GARNL3Q5VVW2 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GARNL3Q5VVW2 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GARNL3Q5VVW2 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GARNL3Q5VVW2 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GARNL3Q5VVW2 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GARNL3Q5VVW2 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GARNL3Q5VVW2 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GARNL3Q5VVW2 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GARNL3Q5VVW2 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GARNL3Q5VVW2 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GARNL3Q5VVW2 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GARNL3Q5VVW2 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GARNL3Q5VVW2 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GARNL3Q5VVW2 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GARNL3Q5VVW2 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GARNL3Q5VVW2 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GARNL3Q5VVW2 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GARNL3Q5VVW2 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GARNL3Q5VVW2 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GARNL3Q5VVW2 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GARNL3Q5VVW2 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GARNL3Q5VVW2 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms