Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTR2

RNF20, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1A, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF20Q5VTR2 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF20Q5VTR2 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF20Q5VTR2 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF20Q5VTR2 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF20Q5VTR2 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF20Q5VTR2 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF20Q5VTR2 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF20Q5VTR2 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF20Q5VTR2 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF20Q5VTR2 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF20Q5VTR2 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF20Q5VTR2 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF20Q5VTR2 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF20Q5VTR2 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF20Q5VTR2 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF20Q5VTR2 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF20Q5VTR2 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF20Q5VTR2 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF20Q5VTR2 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF20Q5VTR2 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF20Q5VTR2 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF20Q5VTR2 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF20Q5VTR2 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF20Q5VTR2 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF20Q5VTR2 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF20Q5VTR2 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF20Q5VTR2 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF20Q5VTR2 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF20Q5VTR2 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF20Q5VTR2 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF20Q5VTR2 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF20Q5VTR2 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF20Q5VTR2 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF20Q5VTR2 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF20Q5VTR2 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF20Q5VTR2 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF20Q5VTR2 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF20Q5VTR2 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF20Q5VTR2 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF20Q5VTR2 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF20Q5VTR2 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF20Q5VTR2 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF20Q5VTR2 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF20Q5VTR2 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF20Q5VTR2 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF20Q5VTR2 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF20Q5VTR2 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF20Q5VTR2 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF20Q5VTR2 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF20Q5VTR2 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF20Q5VTR2 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF20Q5VTR2 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF20Q5VTR2 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF20Q5VTR2 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF20Q5VTR2 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF20Q5VTR2 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF20Q5VTR2 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF20Q5VTR2 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF20Q5VTR2 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF20Q5VTR2 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF20Q5VTR2 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF20Q5VTR2 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF20Q5VTR2 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF20Q5VTR2 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF20Q5VTR2 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF20Q5VTR2 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF20Q5VTR2 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF20Q5VTR2 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF20Q5VTR2 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RNF20Q5VTR2 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RNF20Q5VTR2 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF20Q5VTR2 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF20Q5VTR2 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF20Q5VTR2 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF20Q5VTR2 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF20Q5VTR2 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF20Q5VTR2 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF20Q5VTR2 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF20Q5VTR2 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF20Q5VTR2 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF20Q5VTR2 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF20Q5VTR2 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF20Q5VTR2 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF20Q5VTR2 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF20Q5VTR2 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF20Q5VTR2 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF20Q5VTR2 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF20Q5VTR2 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF20Q5VTR2 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF20Q5VTR2 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF20Q5VTR2 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF20Q5VTR2 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF20Q5VTR2 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF20Q5VTR2 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF20Q5VTR2 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF20Q5VTR2 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF20Q5VTR2 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF20Q5VTR2 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF20Q5VTR2 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF20Q5VTR2 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms