Protein–RNA interactions for Protein: Q5U3C3

TMEM164, Transmembrane protein 164, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM164Q5U3C3 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMEM164Q5U3C3 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TMEM164Q5U3C3 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMEM164Q5U3C3 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMEM164Q5U3C3 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMEM164Q5U3C3 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMEM164Q5U3C3 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMEM164Q5U3C3 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMEM164Q5U3C3 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.46
TMEM164Q5U3C3 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM164Q5U3C3 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM164Q5U3C3 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM164Q5U3C3 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM164Q5U3C3 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM164Q5U3C3 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM164Q5U3C3 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM164Q5U3C3 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM164Q5U3C3 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM164Q5U3C3 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM164Q5U3C3 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM164Q5U3C3 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM164Q5U3C3 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM164Q5U3C3 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM164Q5U3C3 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM164Q5U3C3 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM164Q5U3C3 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM164Q5U3C3 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM164Q5U3C3 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM164Q5U3C3 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM164Q5U3C3 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM164Q5U3C3 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM164Q5U3C3 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM164Q5U3C3 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM164Q5U3C3 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM164Q5U3C3 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM164Q5U3C3 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM164Q5U3C3 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM164Q5U3C3 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM164Q5U3C3 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM164Q5U3C3 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM164Q5U3C3 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM164Q5U3C3 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM164Q5U3C3 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM164Q5U3C3 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM164Q5U3C3 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM164Q5U3C3 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM164Q5U3C3 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM164Q5U3C3 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMEM164Q5U3C3 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMEM164Q5U3C3 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMEM164Q5U3C3 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMEM164Q5U3C3 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMEM164Q5U3C3 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMEM164Q5U3C3 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMEM164Q5U3C3 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
TMEM164Q5U3C3 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMEM164Q5U3C3 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMEM164Q5U3C3 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMEM164Q5U3C3 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMEM164Q5U3C3 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMEM164Q5U3C3 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMEM164Q5U3C3 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMEM164Q5U3C3 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMEM164Q5U3C3 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMEM164Q5U3C3 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMEM164Q5U3C3 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMEM164Q5U3C3 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMEM164Q5U3C3 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMEM164Q5U3C3 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMEM164Q5U3C3 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMEM164Q5U3C3 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TMEM164Q5U3C3 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMEM164Q5U3C3 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMEM164Q5U3C3 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TMEM164Q5U3C3 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TMEM164Q5U3C3 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TMEM164Q5U3C3 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMEM164Q5U3C3 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMEM164Q5U3C3 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMEM164Q5U3C3 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMEM164Q5U3C3 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMEM164Q5U3C3 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMEM164Q5U3C3 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMEM164Q5U3C3 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMEM164Q5U3C3 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMEM164Q5U3C3 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMEM164Q5U3C3 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMEM164Q5U3C3 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMEM164Q5U3C3 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMEM164Q5U3C3 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMEM164Q5U3C3 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMEM164Q5U3C3 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMEM164Q5U3C3 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMEM164Q5U3C3 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMEM164Q5U3C3 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMEM164Q5U3C3 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMEM164Q5U3C3 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMEM164Q5U3C3 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
TMEM164Q5U3C3 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMEM164Q5U3C3 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms