Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVX7

C1orf141, Uncharacterized protein C1orf141, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf141Q5JVX7 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
C1orf141Q5JVX7 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
C1orf141Q5JVX7 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
C1orf141Q5JVX7 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
C1orf141Q5JVX7 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
C1orf141Q5JVX7 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
C1orf141Q5JVX7 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
C1orf141Q5JVX7 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
C1orf141Q5JVX7 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
C1orf141Q5JVX7 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
C1orf141Q5JVX7 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
C1orf141Q5JVX7 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
C1orf141Q5JVX7 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
C1orf141Q5JVX7 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
C1orf141Q5JVX7 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
C1orf141Q5JVX7 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
C1orf141Q5JVX7 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
C1orf141Q5JVX7 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
C1orf141Q5JVX7 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
C1orf141Q5JVX7 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
C1orf141Q5JVX7 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
C1orf141Q5JVX7 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
C1orf141Q5JVX7 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
C1orf141Q5JVX7 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
C1orf141Q5JVX7 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
C1orf141Q5JVX7 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
C1orf141Q5JVX7 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
C1orf141Q5JVX7 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
C1orf141Q5JVX7 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
C1orf141Q5JVX7 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
C1orf141Q5JVX7 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
C1orf141Q5JVX7 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
C1orf141Q5JVX7 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
C1orf141Q5JVX7 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
C1orf141Q5JVX7 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
C1orf141Q5JVX7 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
C1orf141Q5JVX7 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
C1orf141Q5JVX7 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
C1orf141Q5JVX7 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
C1orf141Q5JVX7 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
C1orf141Q5JVX7 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
C1orf141Q5JVX7 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
C1orf141Q5JVX7 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
C1orf141Q5JVX7 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
C1orf141Q5JVX7 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
C1orf141Q5JVX7 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
C1orf141Q5JVX7 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
C1orf141Q5JVX7 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
C1orf141Q5JVX7 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
C1orf141Q5JVX7 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
C1orf141Q5JVX7 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
C1orf141Q5JVX7 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
C1orf141Q5JVX7 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
C1orf141Q5JVX7 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
C1orf141Q5JVX7 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
C1orf141Q5JVX7 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
C1orf141Q5JVX7 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
C1orf141Q5JVX7 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
C1orf141Q5JVX7 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
C1orf141Q5JVX7 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
C1orf141Q5JVX7 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
C1orf141Q5JVX7 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
C1orf141Q5JVX7 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
C1orf141Q5JVX7 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
C1orf141Q5JVX7 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
C1orf141Q5JVX7 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
C1orf141Q5JVX7 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
C1orf141Q5JVX7 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
C1orf141Q5JVX7 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
C1orf141Q5JVX7 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
C1orf141Q5JVX7 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
C1orf141Q5JVX7 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
C1orf141Q5JVX7 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
C1orf141Q5JVX7 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
C1orf141Q5JVX7 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
C1orf141Q5JVX7 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
C1orf141Q5JVX7 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
C1orf141Q5JVX7 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
C1orf141Q5JVX7 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
C1orf141Q5JVX7 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
C1orf141Q5JVX7 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
C1orf141Q5JVX7 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
C1orf141Q5JVX7 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
C1orf141Q5JVX7 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
C1orf141Q5JVX7 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
C1orf141Q5JVX7 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
C1orf141Q5JVX7 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
C1orf141Q5JVX7 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
C1orf141Q5JVX7 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
C1orf141Q5JVX7 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
C1orf141Q5JVX7 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
C1orf141Q5JVX7 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
C1orf141Q5JVX7 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
C1orf141Q5JVX7 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
C1orf141Q5JVX7 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
C1orf141Q5JVX7 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
C1orf141Q5JVX7 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
C1orf141Q5JVX7 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
C1orf141Q5JVX7 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
C1orf141Q5JVX7 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms