Protein–RNA interactions for Protein: Q5JTW2

CEP78, Centrosomal protein of 78 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP78Q5JTW2 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CEP78Q5JTW2 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CEP78Q5JTW2 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CEP78Q5JTW2 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CEP78Q5JTW2 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CEP78Q5JTW2 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CEP78Q5JTW2 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CEP78Q5JTW2 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CEP78Q5JTW2 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CEP78Q5JTW2 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CEP78Q5JTW2 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CEP78Q5JTW2 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CEP78Q5JTW2 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CEP78Q5JTW2 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CEP78Q5JTW2 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CEP78Q5JTW2 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CEP78Q5JTW2 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CEP78Q5JTW2 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CEP78Q5JTW2 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CEP78Q5JTW2 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CEP78Q5JTW2 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CEP78Q5JTW2 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CEP78Q5JTW2 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CEP78Q5JTW2 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CEP78Q5JTW2 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CEP78Q5JTW2 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CEP78Q5JTW2 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CEP78Q5JTW2 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CEP78Q5JTW2 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CEP78Q5JTW2 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CEP78Q5JTW2 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CEP78Q5JTW2 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CEP78Q5JTW2 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CEP78Q5JTW2 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CEP78Q5JTW2 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CEP78Q5JTW2 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CEP78Q5JTW2 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CEP78Q5JTW2 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CEP78Q5JTW2 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CEP78Q5JTW2 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CEP78Q5JTW2 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CEP78Q5JTW2 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CEP78Q5JTW2 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CEP78Q5JTW2 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CEP78Q5JTW2 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CEP78Q5JTW2 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CEP78Q5JTW2 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CEP78Q5JTW2 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CEP78Q5JTW2 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CEP78Q5JTW2 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CEP78Q5JTW2 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CEP78Q5JTW2 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CEP78Q5JTW2 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CEP78Q5JTW2 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CEP78Q5JTW2 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CEP78Q5JTW2 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CEP78Q5JTW2 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CEP78Q5JTW2 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CEP78Q5JTW2 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CEP78Q5JTW2 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CEP78Q5JTW2 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CEP78Q5JTW2 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CEP78Q5JTW2 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CEP78Q5JTW2 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CEP78Q5JTW2 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CEP78Q5JTW2 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CEP78Q5JTW2 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CEP78Q5JTW2 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CEP78Q5JTW2 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CEP78Q5JTW2 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CEP78Q5JTW2 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CEP78Q5JTW2 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CEP78Q5JTW2 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CEP78Q5JTW2 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CEP78Q5JTW2 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CEP78Q5JTW2 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CEP78Q5JTW2 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CEP78Q5JTW2 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CEP78Q5JTW2 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CEP78Q5JTW2 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CEP78Q5JTW2 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CEP78Q5JTW2 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CEP78Q5JTW2 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CEP78Q5JTW2 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CEP78Q5JTW2 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CEP78Q5JTW2 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CEP78Q5JTW2 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CEP78Q5JTW2 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CEP78Q5JTW2 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CEP78Q5JTW2 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CEP78Q5JTW2 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CEP78Q5JTW2 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CEP78Q5JTW2 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CEP78Q5JTW2 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CEP78Q5JTW2 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CEP78Q5JTW2 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CEP78Q5JTW2 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CEP78Q5JTW2 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CEP78Q5JTW2 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CEP78Q5JTW2 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms