Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJE1

CCDC178, Coiled-coil domain-containing protein 178, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC178Q5BJE1 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC178Q5BJE1 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC178Q5BJE1 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC178Q5BJE1 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC178Q5BJE1 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC178Q5BJE1 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC178Q5BJE1 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC178Q5BJE1 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC178Q5BJE1 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC178Q5BJE1 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC178Q5BJE1 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
CCDC178Q5BJE1 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CCDC178Q5BJE1 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CCDC178Q5BJE1 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC178Q5BJE1 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC178Q5BJE1 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC178Q5BJE1 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC178Q5BJE1 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC178Q5BJE1 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC178Q5BJE1 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC178Q5BJE1 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC178Q5BJE1 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC178Q5BJE1 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC178Q5BJE1 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC178Q5BJE1 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC178Q5BJE1 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC178Q5BJE1 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC178Q5BJE1 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC178Q5BJE1 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC178Q5BJE1 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC178Q5BJE1 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC178Q5BJE1 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC178Q5BJE1 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC178Q5BJE1 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC178Q5BJE1 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC178Q5BJE1 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC178Q5BJE1 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC178Q5BJE1 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC178Q5BJE1 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC178Q5BJE1 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC178Q5BJE1 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC178Q5BJE1 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC178Q5BJE1 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC178Q5BJE1 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC178Q5BJE1 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC178Q5BJE1 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC178Q5BJE1 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC178Q5BJE1 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC178Q5BJE1 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC178Q5BJE1 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC178Q5BJE1 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC178Q5BJE1 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC178Q5BJE1 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC178Q5BJE1 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC178Q5BJE1 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC178Q5BJE1 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC178Q5BJE1 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC178Q5BJE1 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC178Q5BJE1 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC178Q5BJE1 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC178Q5BJE1 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC178Q5BJE1 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC178Q5BJE1 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC178Q5BJE1 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC178Q5BJE1 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC178Q5BJE1 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC178Q5BJE1 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC178Q5BJE1 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC178Q5BJE1 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC178Q5BJE1 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC178Q5BJE1 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC178Q5BJE1 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC178Q5BJE1 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC178Q5BJE1 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC178Q5BJE1 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC178Q5BJE1 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC178Q5BJE1 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC178Q5BJE1 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC178Q5BJE1 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC178Q5BJE1 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC178Q5BJE1 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC178Q5BJE1 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC178Q5BJE1 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC178Q5BJE1 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC178Q5BJE1 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC178Q5BJE1 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC178Q5BJE1 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC178Q5BJE1 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC178Q5BJE1 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC178Q5BJE1 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC178Q5BJE1 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC178Q5BJE1 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC178Q5BJE1 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC178Q5BJE1 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC178Q5BJE1 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC178Q5BJE1 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC178Q5BJE1 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC178Q5BJE1 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC178Q5BJE1 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC178Q5BJE1 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms