Protein–RNA interactions for Protein: Q58F21

BRDT, Bromodomain testis-specific protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRDTQ58F21 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRDTQ58F21 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRDTQ58F21 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRDTQ58F21 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRDTQ58F21 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRDTQ58F21 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRDTQ58F21 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BRDTQ58F21 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BRDTQ58F21 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BRDTQ58F21 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BRDTQ58F21 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BRDTQ58F21 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BRDTQ58F21 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BRDTQ58F21 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BRDTQ58F21 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
BRDTQ58F21 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BRDTQ58F21 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BRDTQ58F21 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BRDTQ58F21 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BRDTQ58F21 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BRDTQ58F21 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BRDTQ58F21 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BRDTQ58F21 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
BRDTQ58F21 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BRDTQ58F21 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BRDTQ58F21 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BRDTQ58F21 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BRDTQ58F21 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRDTQ58F21 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRDTQ58F21 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRDTQ58F21 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRDTQ58F21 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRDTQ58F21 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRDTQ58F21 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRDTQ58F21 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRDTQ58F21 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRDTQ58F21 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRDTQ58F21 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRDTQ58F21 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRDTQ58F21 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRDTQ58F21 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRDTQ58F21 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRDTQ58F21 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRDTQ58F21 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRDTQ58F21 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRDTQ58F21 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRDTQ58F21 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRDTQ58F21 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRDTQ58F21 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRDTQ58F21 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRDTQ58F21 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRDTQ58F21 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRDTQ58F21 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRDTQ58F21 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRDTQ58F21 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRDTQ58F21 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRDTQ58F21 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRDTQ58F21 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRDTQ58F21 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
BRDTQ58F21 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
BRDTQ58F21 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRDTQ58F21 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRDTQ58F21 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRDTQ58F21 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRDTQ58F21 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRDTQ58F21 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRDTQ58F21 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRDTQ58F21 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRDTQ58F21 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRDTQ58F21 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRDTQ58F21 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
BRDTQ58F21 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BRDTQ58F21 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BRDTQ58F21 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BRDTQ58F21 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BRDTQ58F21 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BRDTQ58F21 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BRDTQ58F21 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BRDTQ58F21 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BRDTQ58F21 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BRDTQ58F21 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BRDTQ58F21 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BRDTQ58F21 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BRDTQ58F21 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRDTQ58F21 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRDTQ58F21 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRDTQ58F21 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRDTQ58F21 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRDTQ58F21 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRDTQ58F21 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRDTQ58F21 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRDTQ58F21 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRDTQ58F21 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRDTQ58F21 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRDTQ58F21 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRDTQ58F21 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRDTQ58F21 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRDTQ58F21 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRDTQ58F21 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRDTQ58F21 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms