Protein–RNA interactions for Protein: Q58EX2

SDK2, Protein sidekick-2, humanhuman

Predictions only

Length 2,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDK2Q58EX2 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SDK2Q58EX2 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SDK2Q58EX2 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SDK2Q58EX2 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SDK2Q58EX2 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SDK2Q58EX2 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SDK2Q58EX2 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SDK2Q58EX2 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SDK2Q58EX2 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SDK2Q58EX2 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SDK2Q58EX2 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SDK2Q58EX2 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SDK2Q58EX2 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SDK2Q58EX2 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SDK2Q58EX2 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SDK2Q58EX2 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SDK2Q58EX2 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SDK2Q58EX2 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SDK2Q58EX2 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SDK2Q58EX2 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SDK2Q58EX2 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SDK2Q58EX2 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SDK2Q58EX2 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SDK2Q58EX2 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SDK2Q58EX2 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SDK2Q58EX2 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SDK2Q58EX2 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SDK2Q58EX2 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SDK2Q58EX2 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SDK2Q58EX2 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SDK2Q58EX2 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SDK2Q58EX2 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SDK2Q58EX2 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SDK2Q58EX2 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SDK2Q58EX2 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SDK2Q58EX2 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SDK2Q58EX2 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SDK2Q58EX2 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SDK2Q58EX2 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SDK2Q58EX2 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SDK2Q58EX2 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SDK2Q58EX2 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SDK2Q58EX2 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SDK2Q58EX2 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SDK2Q58EX2 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SDK2Q58EX2 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SDK2Q58EX2 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SDK2Q58EX2 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SDK2Q58EX2 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SDK2Q58EX2 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SDK2Q58EX2 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SDK2Q58EX2 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SDK2Q58EX2 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SDK2Q58EX2 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SDK2Q58EX2 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SDK2Q58EX2 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SDK2Q58EX2 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SDK2Q58EX2 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SDK2Q58EX2 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SDK2Q58EX2 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SDK2Q58EX2 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SDK2Q58EX2 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SDK2Q58EX2 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SDK2Q58EX2 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SDK2Q58EX2 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SDK2Q58EX2 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SDK2Q58EX2 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SDK2Q58EX2 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SDK2Q58EX2 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SDK2Q58EX2 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SDK2Q58EX2 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SDK2Q58EX2 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SDK2Q58EX2 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SDK2Q58EX2 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SDK2Q58EX2 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SDK2Q58EX2 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SDK2Q58EX2 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SDK2Q58EX2 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SDK2Q58EX2 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SDK2Q58EX2 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SDK2Q58EX2 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SDK2Q58EX2 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SDK2Q58EX2 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SDK2Q58EX2 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SDK2Q58EX2 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SDK2Q58EX2 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SDK2Q58EX2 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SDK2Q58EX2 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SDK2Q58EX2 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SDK2Q58EX2 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SDK2Q58EX2 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SDK2Q58EX2 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SDK2Q58EX2 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SDK2Q58EX2 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SDK2Q58EX2 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SDK2Q58EX2 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SDK2Q58EX2 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SDK2Q58EX2 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SDK2Q58EX2 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SDK2Q58EX2 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms