Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RFTN2Q52LD8 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RFTN2Q52LD8 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RFTN2Q52LD8 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
RFTN2Q52LD8 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RFTN2Q52LD8 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RFTN2Q52LD8 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RFTN2Q52LD8 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RFTN2Q52LD8 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RFTN2Q52LD8 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RFTN2Q52LD8 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RFTN2Q52LD8 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RFTN2Q52LD8 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
RFTN2Q52LD8 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RFTN2Q52LD8 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RFTN2Q52LD8 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RFTN2Q52LD8 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RFTN2Q52LD8 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
RFTN2Q52LD8 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RFTN2Q52LD8 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RFTN2Q52LD8 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RFTN2Q52LD8 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
RFTN2Q52LD8 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RFTN2Q52LD8 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RFTN2Q52LD8 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RFTN2Q52LD8 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RFTN2Q52LD8 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
RFTN2Q52LD8 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RFTN2Q52LD8 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RFTN2Q52LD8 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RFTN2Q52LD8 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RFTN2Q52LD8 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RFTN2Q52LD8 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RFTN2Q52LD8 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RFTN2Q52LD8 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RFTN2Q52LD8 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RFTN2Q52LD8 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RFTN2Q52LD8 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RFTN2Q52LD8 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RFTN2Q52LD8 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RFTN2Q52LD8 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RFTN2Q52LD8 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RFTN2Q52LD8 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RFTN2Q52LD8 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RFTN2Q52LD8 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RFTN2Q52LD8 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RFTN2Q52LD8 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RFTN2Q52LD8 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RFTN2Q52LD8 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RFTN2Q52LD8 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RFTN2Q52LD8 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RFTN2Q52LD8 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RFTN2Q52LD8 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RFTN2Q52LD8 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RFTN2Q52LD8 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RFTN2Q52LD8 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RFTN2Q52LD8 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RFTN2Q52LD8 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RFTN2Q52LD8 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RFTN2Q52LD8 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RFTN2Q52LD8 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RFTN2Q52LD8 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RFTN2Q52LD8 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
RFTN2Q52LD8 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RFTN2Q52LD8 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RFTN2Q52LD8 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RFTN2Q52LD8 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RFTN2Q52LD8 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RFTN2Q52LD8 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RFTN2Q52LD8 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RFTN2Q52LD8 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RFTN2Q52LD8 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RFTN2Q52LD8 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RFTN2Q52LD8 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RFTN2Q52LD8 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RFTN2Q52LD8 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RFTN2Q52LD8 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RFTN2Q52LD8 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RFTN2Q52LD8 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
RFTN2Q52LD8 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RFTN2Q52LD8 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RFTN2Q52LD8 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RFTN2Q52LD8 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RFTN2Q52LD8 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RFTN2Q52LD8 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RFTN2Q52LD8 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
RFTN2Q52LD8 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RFTN2Q52LD8 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RFTN2Q52LD8 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RFTN2Q52LD8 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RFTN2Q52LD8 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RFTN2Q52LD8 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RFTN2Q52LD8 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RFTN2Q52LD8 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RFTN2Q52LD8 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
RFTN2Q52LD8 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RFTN2Q52LD8 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RFTN2Q52LD8 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RFTN2Q52LD8 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RFTN2Q52LD8 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms