Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMEM259Q4ZIN3 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMEM259Q4ZIN3 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
TMEM259Q4ZIN3 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
TMEM259Q4ZIN3 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMEM259Q4ZIN3 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMEM259Q4ZIN3 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMEM259Q4ZIN3 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
TMEM259Q4ZIN3 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMEM259Q4ZIN3 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMEM259Q4ZIN3 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMEM259Q4ZIN3 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMEM259Q4ZIN3 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMEM259Q4ZIN3 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMEM259Q4ZIN3 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMEM259Q4ZIN3 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMEM259Q4ZIN3 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMEM259Q4ZIN3 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMEM259Q4ZIN3 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
TMEM259Q4ZIN3 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMEM259Q4ZIN3 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMEM259Q4ZIN3 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMEM259Q4ZIN3 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
TMEM259Q4ZIN3 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMEM259Q4ZIN3 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMEM259Q4ZIN3 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMEM259Q4ZIN3 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMEM259Q4ZIN3 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMEM259Q4ZIN3 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMEM259Q4ZIN3 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMEM259Q4ZIN3 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMEM259Q4ZIN3 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMEM259Q4ZIN3 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMEM259Q4ZIN3 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMEM259Q4ZIN3 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMEM259Q4ZIN3 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMEM259Q4ZIN3 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMEM259Q4ZIN3 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMEM259Q4ZIN3 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMEM259Q4ZIN3 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMEM259Q4ZIN3 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMEM259Q4ZIN3 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMEM259Q4ZIN3 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMEM259Q4ZIN3 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMEM259Q4ZIN3 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMEM259Q4ZIN3 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMEM259Q4ZIN3 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMEM259Q4ZIN3 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMEM259Q4ZIN3 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMEM259Q4ZIN3 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMEM259Q4ZIN3 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMEM259Q4ZIN3 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMEM259Q4ZIN3 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMEM259Q4ZIN3 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMEM259Q4ZIN3 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
TMEM259Q4ZIN3 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMEM259Q4ZIN3 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMEM259Q4ZIN3 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMEM259Q4ZIN3 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMEM259Q4ZIN3 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMEM259Q4ZIN3 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMEM259Q4ZIN3 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMEM259Q4ZIN3 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMEM259Q4ZIN3 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMEM259Q4ZIN3 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMEM259Q4ZIN3 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMEM259Q4ZIN3 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMEM259Q4ZIN3 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMEM259Q4ZIN3 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMEM259Q4ZIN3 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMEM259Q4ZIN3 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMEM259Q4ZIN3 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMEM259Q4ZIN3 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TMEM259Q4ZIN3 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TMEM259Q4ZIN3 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TMEM259Q4ZIN3 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TMEM259Q4ZIN3 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
TMEM259Q4ZIN3 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TMEM259Q4ZIN3 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TMEM259Q4ZIN3 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TMEM259Q4ZIN3 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TMEM259Q4ZIN3 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TMEM259Q4ZIN3 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TMEM259Q4ZIN3 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
TMEM259Q4ZIN3 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TMEM259Q4ZIN3 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TMEM259Q4ZIN3 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TMEM259Q4ZIN3 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TMEM259Q4ZIN3 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TMEM259Q4ZIN3 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TMEM259Q4ZIN3 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TMEM259Q4ZIN3 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TMEM259Q4ZIN3 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TMEM259Q4ZIN3 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMEM259Q4ZIN3 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMEM259Q4ZIN3 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMEM259Q4ZIN3 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
TMEM259Q4ZIN3 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMEM259Q4ZIN3 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMEM259Q4ZIN3 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms