Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTXN3Q4LDR2 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTXN3Q4LDR2 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTXN3Q4LDR2 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTXN3Q4LDR2 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTXN3Q4LDR2 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTXN3Q4LDR2 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTXN3Q4LDR2 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTXN3Q4LDR2 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTXN3Q4LDR2 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CTXN3Q4LDR2 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CTXN3Q4LDR2 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CTXN3Q4LDR2 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTXN3Q4LDR2 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTXN3Q4LDR2 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTXN3Q4LDR2 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTXN3Q4LDR2 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTXN3Q4LDR2 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTXN3Q4LDR2 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTXN3Q4LDR2 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTXN3Q4LDR2 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTXN3Q4LDR2 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTXN3Q4LDR2 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTXN3Q4LDR2 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTXN3Q4LDR2 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTXN3Q4LDR2 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTXN3Q4LDR2 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTXN3Q4LDR2 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTXN3Q4LDR2 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTXN3Q4LDR2 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTXN3Q4LDR2 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTXN3Q4LDR2 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTXN3Q4LDR2 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTXN3Q4LDR2 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CTXN3Q4LDR2 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTXN3Q4LDR2 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTXN3Q4LDR2 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTXN3Q4LDR2 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTXN3Q4LDR2 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTXN3Q4LDR2 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTXN3Q4LDR2 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTXN3Q4LDR2 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTXN3Q4LDR2 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTXN3Q4LDR2 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTXN3Q4LDR2 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTXN3Q4LDR2 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTXN3Q4LDR2 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTXN3Q4LDR2 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTXN3Q4LDR2 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTXN3Q4LDR2 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTXN3Q4LDR2 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTXN3Q4LDR2 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTXN3Q4LDR2 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTXN3Q4LDR2 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CTXN3Q4LDR2 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTXN3Q4LDR2 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTXN3Q4LDR2 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTXN3Q4LDR2 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTXN3Q4LDR2 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTXN3Q4LDR2 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTXN3Q4LDR2 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTXN3Q4LDR2 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTXN3Q4LDR2 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTXN3Q4LDR2 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTXN3Q4LDR2 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTXN3Q4LDR2 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTXN3Q4LDR2 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTXN3Q4LDR2 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTXN3Q4LDR2 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTXN3Q4LDR2 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTXN3Q4LDR2 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTXN3Q4LDR2 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTXN3Q4LDR2 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTXN3Q4LDR2 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTXN3Q4LDR2 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTXN3Q4LDR2 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTXN3Q4LDR2 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTXN3Q4LDR2 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTXN3Q4LDR2 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTXN3Q4LDR2 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTXN3Q4LDR2 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTXN3Q4LDR2 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTXN3Q4LDR2 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTXN3Q4LDR2 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTXN3Q4LDR2 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTXN3Q4LDR2 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTXN3Q4LDR2 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTXN3Q4LDR2 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTXN3Q4LDR2 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTXN3Q4LDR2 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTXN3Q4LDR2 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTXN3Q4LDR2 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTXN3Q4LDR2 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTXN3Q4LDR2 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTXN3Q4LDR2 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTXN3Q4LDR2 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTXN3Q4LDR2 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTXN3Q4LDR2 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTXN3Q4LDR2 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTXN3Q4LDR2 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.1 ms