Protein–RNA interactions for Protein: Q30201

HFE, Hereditary hemochromatosis protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HFEQ30201 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HFEQ30201 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HFEQ30201 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HFEQ30201 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HFEQ30201 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HFEQ30201 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HFEQ30201 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HFEQ30201 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HFEQ30201 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HFEQ30201 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HFEQ30201 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HFEQ30201 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HFEQ30201 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HFEQ30201 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HFEQ30201 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HFEQ30201 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HFEQ30201 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HFEQ30201 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HFEQ30201 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HFEQ30201 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HFEQ30201 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HFEQ30201 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HFEQ30201 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HFEQ30201 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HFEQ30201 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HFEQ30201 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HFEQ30201 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HFEQ30201 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HFEQ30201 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HFEQ30201 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HFEQ30201 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HFEQ30201 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HFEQ30201 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HFEQ30201 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HFEQ30201 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HFEQ30201 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HFEQ30201 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HFEQ30201 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HFEQ30201 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HFEQ30201 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HFEQ30201 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HFEQ30201 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HFEQ30201 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HFEQ30201 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HFEQ30201 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HFEQ30201 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HFEQ30201 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HFEQ30201 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HFEQ30201 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HFEQ30201 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HFEQ30201 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HFEQ30201 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HFEQ30201 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HFEQ30201 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HFEQ30201 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HFEQ30201 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HFEQ30201 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HFEQ30201 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HFEQ30201 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HFEQ30201 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HFEQ30201 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HFEQ30201 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HFEQ30201 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HFEQ30201 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HFEQ30201 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HFEQ30201 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HFEQ30201 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HFEQ30201 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HFEQ30201 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HFEQ30201 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HFEQ30201 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HFEQ30201 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HFEQ30201 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HFEQ30201 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HFEQ30201 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
HFEQ30201 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
HFEQ30201 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
HFEQ30201 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HFEQ30201 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HFEQ30201 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
HFEQ30201 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HFEQ30201 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HFEQ30201 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HFEQ30201 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HFEQ30201 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HFEQ30201 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HFEQ30201 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HFEQ30201 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HFEQ30201 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HFEQ30201 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HFEQ30201 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HFEQ30201 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HFEQ30201 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HFEQ30201 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HFEQ30201 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HFEQ30201 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HFEQ30201 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HFEQ30201 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
HFEQ30201 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HFEQ30201 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms