Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,714 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COL24A1Q17RW2 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
COL24A1Q17RW2 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
COL24A1Q17RW2 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
COL24A1Q17RW2 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
COL24A1Q17RW2 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
COL24A1Q17RW2 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
COL24A1Q17RW2 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
COL24A1Q17RW2 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
COL24A1Q17RW2 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
COL24A1Q17RW2 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
COL24A1Q17RW2 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
COL24A1Q17RW2 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
COL24A1Q17RW2 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
COL24A1Q17RW2 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
COL24A1Q17RW2 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
COL24A1Q17RW2 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
COL24A1Q17RW2 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
COL24A1Q17RW2 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
COL24A1Q17RW2 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
COL24A1Q17RW2 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
COL24A1Q17RW2 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
COL24A1Q17RW2 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
COL24A1Q17RW2 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
COL24A1Q17RW2 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
COL24A1Q17RW2 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
COL24A1Q17RW2 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
COL24A1Q17RW2 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
COL24A1Q17RW2 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
COL24A1Q17RW2 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
COL24A1Q17RW2 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
COL24A1Q17RW2 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
COL24A1Q17RW2 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
COL24A1Q17RW2 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
COL24A1Q17RW2 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
COL24A1Q17RW2 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
COL24A1Q17RW2 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
COL24A1Q17RW2 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
COL24A1Q17RW2 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
COL24A1Q17RW2 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
COL24A1Q17RW2 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
COL24A1Q17RW2 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
COL24A1Q17RW2 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
COL24A1Q17RW2 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
COL24A1Q17RW2 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
COL24A1Q17RW2 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
COL24A1Q17RW2 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
COL24A1Q17RW2 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
COL24A1Q17RW2 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
COL24A1Q17RW2 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
COL24A1Q17RW2 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
COL24A1Q17RW2 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
COL24A1Q17RW2 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
COL24A1Q17RW2 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
COL24A1Q17RW2 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
COL24A1Q17RW2 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
COL24A1Q17RW2 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
COL24A1Q17RW2 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
COL24A1Q17RW2 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
COL24A1Q17RW2 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
COL24A1Q17RW2 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
COL24A1Q17RW2 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
COL24A1Q17RW2 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
COL24A1Q17RW2 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
COL24A1Q17RW2 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
COL24A1Q17RW2 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
COL24A1Q17RW2 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
COL24A1Q17RW2 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
COL24A1Q17RW2 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
COL24A1Q17RW2 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
COL24A1Q17RW2 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
COL24A1Q17RW2 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
COL24A1Q17RW2 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
COL24A1Q17RW2 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
COL24A1Q17RW2 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
COL24A1Q17RW2 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
COL24A1Q17RW2 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
COL24A1Q17RW2 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
COL24A1Q17RW2 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
COL24A1Q17RW2 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
COL24A1Q17RW2 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
COL24A1Q17RW2 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
COL24A1Q17RW2 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
COL24A1Q17RW2 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
COL24A1Q17RW2 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
COL24A1Q17RW2 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
COL24A1Q17RW2 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
COL24A1Q17RW2 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
COL24A1Q17RW2 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
COL24A1Q17RW2 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
COL24A1Q17RW2 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
COL24A1Q17RW2 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
COL24A1Q17RW2 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
COL24A1Q17RW2 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
COL24A1Q17RW2 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
COL24A1Q17RW2 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
COL24A1Q17RW2 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
COL24A1Q17RW2 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
COL24A1Q17RW2 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
COL24A1Q17RW2 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
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