Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms