Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDO1Q16878 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDO1Q16878 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDO1Q16878 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDO1Q16878 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CDO1Q16878 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDO1Q16878 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDO1Q16878 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDO1Q16878 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDO1Q16878 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDO1Q16878 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CDO1Q16878 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDO1Q16878 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDO1Q16878 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDO1Q16878 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDO1Q16878 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDO1Q16878 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDO1Q16878 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDO1Q16878 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDO1Q16878 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDO1Q16878 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDO1Q16878 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDO1Q16878 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDO1Q16878 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDO1Q16878 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDO1Q16878 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDO1Q16878 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDO1Q16878 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDO1Q16878 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDO1Q16878 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDO1Q16878 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDO1Q16878 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDO1Q16878 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDO1Q16878 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDO1Q16878 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDO1Q16878 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDO1Q16878 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDO1Q16878 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDO1Q16878 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CDO1Q16878 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDO1Q16878 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDO1Q16878 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDO1Q16878 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDO1Q16878 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDO1Q16878 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDO1Q16878 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDO1Q16878 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDO1Q16878 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDO1Q16878 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDO1Q16878 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDO1Q16878 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDO1Q16878 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDO1Q16878 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDO1Q16878 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDO1Q16878 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDO1Q16878 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDO1Q16878 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDO1Q16878 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CDO1Q16878 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDO1Q16878 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDO1Q16878 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CDO1Q16878 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDO1Q16878 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CDO1Q16878 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDO1Q16878 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CDO1Q16878 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDO1Q16878 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDO1Q16878 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDO1Q16878 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDO1Q16878 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDO1Q16878 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDO1Q16878 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDO1Q16878 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDO1Q16878 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDO1Q16878 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDO1Q16878 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CDO1Q16878 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDO1Q16878 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDO1Q16878 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDO1Q16878 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDO1Q16878 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDO1Q16878 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDO1Q16878 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDO1Q16878 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDO1Q16878 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CDO1Q16878 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDO1Q16878 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDO1Q16878 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDO1Q16878 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CDO1Q16878 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CDO1Q16878 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CDO1Q16878 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CDO1Q16878 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDO1Q16878 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDO1Q16878 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDO1Q16878 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDO1Q16878 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDO1Q16878 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDO1Q16878 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDO1Q16878 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
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