Protein–RNA interactions for Protein: Q16821

PPP1R3A, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 3A, humanhuman

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R3AQ16821 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PPP1R3AQ16821 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms