Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RTN1Q16799 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RTN1Q16799 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RTN1Q16799 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RTN1Q16799 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RTN1Q16799 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RTN1Q16799 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RTN1Q16799 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RTN1Q16799 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RTN1Q16799 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RTN1Q16799 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RTN1Q16799 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RTN1Q16799 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RTN1Q16799 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RTN1Q16799 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RTN1Q16799 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RTN1Q16799 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RTN1Q16799 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RTN1Q16799 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RTN1Q16799 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RTN1Q16799 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RTN1Q16799 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RTN1Q16799 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RTN1Q16799 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RTN1Q16799 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RTN1Q16799 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RTN1Q16799 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RTN1Q16799 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RTN1Q16799 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RTN1Q16799 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RTN1Q16799 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RTN1Q16799 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RTN1Q16799 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RTN1Q16799 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RTN1Q16799 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RTN1Q16799 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RTN1Q16799 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RTN1Q16799 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RTN1Q16799 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RTN1Q16799 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RTN1Q16799 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RTN1Q16799 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RTN1Q16799 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RTN1Q16799 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RTN1Q16799 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RTN1Q16799 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RTN1Q16799 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RTN1Q16799 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RTN1Q16799 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RTN1Q16799 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RTN1Q16799 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RTN1Q16799 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RTN1Q16799 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RTN1Q16799 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RTN1Q16799 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RTN1Q16799 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RTN1Q16799 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RTN1Q16799 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RTN1Q16799 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RTN1Q16799 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RTN1Q16799 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RTN1Q16799 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RTN1Q16799 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RTN1Q16799 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RTN1Q16799 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RTN1Q16799 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RTN1Q16799 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RTN1Q16799 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RTN1Q16799 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RTN1Q16799 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RTN1Q16799 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RTN1Q16799 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RTN1Q16799 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RTN1Q16799 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RTN1Q16799 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RTN1Q16799 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RTN1Q16799 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RTN1Q16799 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RTN1Q16799 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RTN1Q16799 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RTN1Q16799 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RTN1Q16799 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RTN1Q16799 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RTN1Q16799 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RTN1Q16799 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RTN1Q16799 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RTN1Q16799 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RTN1Q16799 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RTN1Q16799 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RTN1Q16799 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RTN1Q16799 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RTN1Q16799 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RTN1Q16799 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RTN1Q16799 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RTN1Q16799 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RTN1Q16799 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RTN1Q16799 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RTN1Q16799 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RTN1Q16799 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RTN1Q16799 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
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