Protein–RNA interactions for Protein: Q16798

ME3, NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME3Q16798 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ME3Q16798 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ME3Q16798 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ME3Q16798 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ME3Q16798 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ME3Q16798 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ME3Q16798 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ME3Q16798 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ME3Q16798 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ME3Q16798 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ME3Q16798 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ME3Q16798 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ME3Q16798 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ME3Q16798 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ME3Q16798 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ME3Q16798 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ME3Q16798 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ME3Q16798 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ME3Q16798 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ME3Q16798 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ME3Q16798 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ME3Q16798 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ME3Q16798 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ME3Q16798 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ME3Q16798 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ME3Q16798 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ME3Q16798 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ME3Q16798 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ME3Q16798 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ME3Q16798 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ME3Q16798 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ME3Q16798 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ME3Q16798 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ME3Q16798 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ME3Q16798 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ME3Q16798 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ME3Q16798 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ME3Q16798 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ME3Q16798 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ME3Q16798 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ME3Q16798 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ME3Q16798 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ME3Q16798 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ME3Q16798 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ME3Q16798 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ME3Q16798 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ME3Q16798 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ME3Q16798 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ME3Q16798 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ME3Q16798 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ME3Q16798 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ME3Q16798 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ME3Q16798 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ME3Q16798 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ME3Q16798 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ME3Q16798 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ME3Q16798 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ME3Q16798 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ME3Q16798 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ME3Q16798 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ME3Q16798 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ME3Q16798 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ME3Q16798 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ME3Q16798 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ME3Q16798 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ME3Q16798 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ME3Q16798 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ME3Q16798 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ME3Q16798 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ME3Q16798 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ME3Q16798 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ME3Q16798 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ME3Q16798 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ME3Q16798 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ME3Q16798 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ME3Q16798 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ME3Q16798 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ME3Q16798 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ME3Q16798 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ME3Q16798 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ME3Q16798 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ME3Q16798 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ME3Q16798 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ME3Q16798 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ME3Q16798 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ME3Q16798 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ME3Q16798 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ME3Q16798 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ME3Q16798 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ME3Q16798 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ME3Q16798 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ME3Q16798 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ME3Q16798 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ME3Q16798 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ME3Q16798 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ME3Q16798 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ME3Q16798 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ME3Q16798 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ME3Q16798 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ME3Q16798 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
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