Protein–RNA interactions for Protein: Q16621

NFE2, Transcription factor NF-E2 45 kDa subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFE2Q16621 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NFE2Q16621 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NFE2Q16621 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NFE2Q16621 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NFE2Q16621 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
NFE2Q16621 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
NFE2Q16621 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NFE2Q16621 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
NFE2Q16621 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
NFE2Q16621 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NFE2Q16621 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NFE2Q16621 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NFE2Q16621 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NFE2Q16621 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NFE2Q16621 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NFE2Q16621 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NFE2Q16621 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NFE2Q16621 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NFE2Q16621 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NFE2Q16621 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
NFE2Q16621 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NFE2Q16621 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NFE2Q16621 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NFE2Q16621 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NFE2Q16621 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NFE2Q16621 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NFE2Q16621 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NFE2Q16621 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
NFE2Q16621 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NFE2Q16621 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NFE2Q16621 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NFE2Q16621 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NFE2Q16621 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NFE2Q16621 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NFE2Q16621 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NFE2Q16621 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NFE2Q16621 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NFE2Q16621 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NFE2Q16621 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NFE2Q16621 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NFE2Q16621 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NFE2Q16621 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
NFE2Q16621 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
NFE2Q16621 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NFE2Q16621 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NFE2Q16621 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NFE2Q16621 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
NFE2Q16621 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NFE2Q16621 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
NFE2Q16621 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NFE2Q16621 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
NFE2Q16621 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
NFE2Q16621 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NFE2Q16621 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NFE2Q16621 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NFE2Q16621 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NFE2Q16621 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NFE2Q16621 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NFE2Q16621 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NFE2Q16621 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NFE2Q16621 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NFE2Q16621 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NFE2Q16621 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NFE2Q16621 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NFE2Q16621 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NFE2Q16621 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NFE2Q16621 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NFE2Q16621 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NFE2Q16621 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NFE2Q16621 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NFE2Q16621 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NFE2Q16621 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NFE2Q16621 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NFE2Q16621 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NFE2Q16621 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
NFE2Q16621 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
NFE2Q16621 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NFE2Q16621 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NFE2Q16621 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NFE2Q16621 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NFE2Q16621 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NFE2Q16621 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NFE2Q16621 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NFE2Q16621 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NFE2Q16621 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NFE2Q16621 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NFE2Q16621 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NFE2Q16621 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NFE2Q16621 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NFE2Q16621 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NFE2Q16621 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NFE2Q16621 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NFE2Q16621 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
NFE2Q16621 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NFE2Q16621 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NFE2Q16621 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NFE2Q16621 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NFE2Q16621 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NFE2Q16621 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NFE2Q16621 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
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