Protein–RNA interactions for Protein: Q16620

NTRK2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK2Q16620 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NTRK2Q16620 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NTRK2Q16620 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NTRK2Q16620 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NTRK2Q16620 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NTRK2Q16620 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NTRK2Q16620 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NTRK2Q16620 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
NTRK2Q16620 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NTRK2Q16620 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NTRK2Q16620 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NTRK2Q16620 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NTRK2Q16620 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NTRK2Q16620 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NTRK2Q16620 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NTRK2Q16620 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NTRK2Q16620 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NTRK2Q16620 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NTRK2Q16620 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NTRK2Q16620 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
NTRK2Q16620 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
NTRK2Q16620 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
NTRK2Q16620 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.42
NTRK2Q16620 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NTRK2Q16620 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NTRK2Q16620 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NTRK2Q16620 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NTRK2Q16620 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NTRK2Q16620 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NTRK2Q16620 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NTRK2Q16620 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NTRK2Q16620 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
NTRK2Q16620 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NTRK2Q16620 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NTRK2Q16620 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NTRK2Q16620 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NTRK2Q16620 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NTRK2Q16620 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NTRK2Q16620 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
NTRK2Q16620 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NTRK2Q16620 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NTRK2Q16620 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NTRK2Q16620 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NTRK2Q16620 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
NTRK2Q16620 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NTRK2Q16620 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NTRK2Q16620 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NTRK2Q16620 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NTRK2Q16620 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NTRK2Q16620 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NTRK2Q16620 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NTRK2Q16620 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NTRK2Q16620 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NTRK2Q16620 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NTRK2Q16620 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NTRK2Q16620 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NTRK2Q16620 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NTRK2Q16620 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NTRK2Q16620 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NTRK2Q16620 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NTRK2Q16620 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NTRK2Q16620 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NTRK2Q16620 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NTRK2Q16620 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NTRK2Q16620 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NTRK2Q16620 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NTRK2Q16620 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NTRK2Q16620 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NTRK2Q16620 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
NTRK2Q16620 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
NTRK2Q16620 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NTRK2Q16620 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NTRK2Q16620 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NTRK2Q16620 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NTRK2Q16620 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NTRK2Q16620 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NTRK2Q16620 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NTRK2Q16620 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NTRK2Q16620 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NTRK2Q16620 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NTRK2Q16620 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NTRK2Q16620 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NTRK2Q16620 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NTRK2Q16620 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NTRK2Q16620 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NTRK2Q16620 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NTRK2Q16620 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NTRK2Q16620 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NTRK2Q16620 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NTRK2Q16620 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NTRK2Q16620 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NTRK2Q16620 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NTRK2Q16620 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
NTRK2Q16620 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NTRK2Q16620 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
NTRK2Q16620 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NTRK2Q16620 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NTRK2Q16620 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NTRK2Q16620 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NTRK2Q16620 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms